RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 WFDC5Q8TCV5 224 aa22.54■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 THAP9Q9H5L6 903 aa22.54■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 POPDC2Q9HBU9 364 aa22.54■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 ST8SIA6P61647 398 aa22.53■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 RPS24P62847 133 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 SHC2P98077 582 aa22.53■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 APBA1Q02410 837 aa22.53■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 FOXC1Q12948 553 aa22.53■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 PDCLQ13371 301 aa22.53■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 BEND5Q7L4P6 421 aa22.53■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 TMEM110Q86TL2 294 aa22.53■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 FIBINQ8TAL6 211 aa22.53■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 LHX5Q9H2C1 402 aa22.53■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 TJP2Q9UDY2 1190 aa22.53■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 SUN2Q9UH99 717 aa22.53■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 CYTH4Q9UIA0 394 aa22.53■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 BECN2A8MW95 431 aa22.52■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 PON1P27169 355 aa22.52■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 PTK2Q05397 1052 aa22.52■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 PTPRNQ16849 979 aa22.52■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 MS4A13Q5J8X5 152 aa22.52■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 DCAF12L1Q5VU92 463 aa22.52■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 CHSY1Q86X52 802 aa22.52■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.52■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 PASD1Q8IV76 773 aa22.52■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.52■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 LGI2Q8N0V4 545 aa22.52■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 CFAP52Q8N1V2 620 aa22.52■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 OR2I1PQ8NGU4 316 aa22.52■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 SLC39A13Q96H72 371 aa22.52■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 FBRSQ9HAH7 460 aa22.52■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa22.52■■□□□ 1.2
CIPC-208ENST00000557115 A0A1B0GTW7 788 aa22.51■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 METTL12A8MUP2 240 aa22.51■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 H0Y626 953 aa22.51■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 IGLV3-19P01714 112 aa22.51■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 DNTTP04053 509 aa22.51■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 DCAF6Q58WW2 860 aa22.51■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 RAP1GAP2Q684P5 730 aa22.51■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 SNX19Q92543 992 aa22.51■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 RNF34Q969K3 372 aa22.51■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 NOX5Q96PH1 765 aa22.51■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.51■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 PRSS16Q9NQE7 514 aa22.51■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.51■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 CEP83Q9Y592 693 aa22.51■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 TPRP12270 2363 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa22.5■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 MOCS3O95396 460 aa22.5■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 KRT9P35527 623 aa22.5■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 CDK17Q00537 523 aa22.5■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 SEMA3BQ13214 749 aa22.5■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 MAN2A1Q16706 1144 aa22.5■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 ST3GAL2Q16842 350 aa22.5■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa22.5■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 DNASE2BQ8WZ79 361 aa22.5■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 SHC3Q92529 594 aa22.5■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 MYEOVQ96EZ4 313 aa22.5■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa22.5■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 BTN2A3PQ96KV6 586 aa22.5■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 FAM204AQ9H8W3 233 aa22.5■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 COX16Q9P0S2 106 aa22.5■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 DACH1Q9UI36 760 aa22.5■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.5■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 ASLP04424 464 aa22.49■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 CSKP41240 450 aa22.49■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 SNX16P57768 344 aa22.49■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 ZBTB16Q05516 673 aa22.49■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 TAF5Q15542 800 aa22.49■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 EFHC1Q5JVL4 640 aa22.49■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 GANCQ8TET4 914 aa22.49■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 CPXM1Q96SM3 734 aa22.49■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa22.49■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 SYNCQ9H7C4 482 aa22.49■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 UPK3BL1B0FP48 263 aa22.48■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 UPK3BL2E5RIL1 263 aa22.48■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 F5H5T6 163 aa22.48■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 SLC2A3P11169 496 aa22.48■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 ABCB4P21439 1286 aa22.48■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 TACR2P21452 398 aa22.48■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 RPS14P62263 151 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 GRIK2Q13002 908 aa22.48■■□□□ 1.19
CIPC-208ENST00000557115 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms