RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A0B4J269	797 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC12A8	A0AV02	714 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ACOT7	O00154	380 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PODXL	O00592	558 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PTGES	O14684	152 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	NCK2	O43639	380 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	EXTL3	O43909	919 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	EXOC3	O60645	756 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	KRT37	O76014	449 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	KIF20A	O95235	890 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	TNNC2	P02585	160 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	WEE2	P0C1S8	567 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	LINC00271	P0C7V0	271 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	EPCAM	P16422	314 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	SCP2	P22307	547 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PROZ	P22891	400 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ELF1	P32519	619 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	GLUD2	P49448	558 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	MCL1	Q07820	350 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	BFSP1	Q12934	665 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	STK4	Q13043	487 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ADAM15	Q13444	863 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CAMK1	Q14012	370 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CPZ	Q66K79	652 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	VASN	Q6EMK4	673 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CES5A	Q6NT32	575 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	FUT10	Q6P4F1	479 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	USP37	Q86T82	979 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	METTL23	Q86XA0	190 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	C1QL4	Q86Z23	238 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	GPD1L	Q8N335	351 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	HVCN1	Q96D96	273 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	MFSD3	Q96ES6	412 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	SNX27	Q96L92	541 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	UROC1	Q96N76	676 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	FNBP1	Q96RU3	617 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CD207	Q9UJ71	328 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	WASF3	Q9UPY6	502 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	LZTS1	Q9Y250	596 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	TRANK1	O15050	2925 aa		5	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61	4e-12	■■■■■ 275.7
ATXN3-238	ENST00000556288	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A1B0GTL3	188 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	TTC26	A0AVF1	554 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288		H7C4K7	107 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PRRG1	O14668	218 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	FFAR3	O14843	346 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	KLRC4	O43908	158 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	IL18RAP	O95256	599 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CTSA	P10619	480 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNE1	P15382	129 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ADSS	P30520	456 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	OR1D2	P34982	312 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	HOXD13	P35453	343 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	DSC1	Q08554	894 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ADAM9	Q13443	819 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	BIRC3	Q13489	604 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	TRPC3	Q13507	836 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	STIM1	Q13586	685 aa		4.99	□□□□□ -1.61

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