RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553876.2

RBM23-208, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 267 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-208	ENST00000553876	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	KCND3	Q9UK17	655 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	TUBB4A	P04350	444 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	KEL	P23276	732 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	CNTF	P26441	200 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	CERS1	P27544	350 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	FAM187B	Q17R55	369 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	PDP2	Q9P2J9	529 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	RAB21	Q9UL25	225 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	NKX2-8	O15522	239 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	POLB	P06746	335 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	MATN1	P21941	496 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	GALNS	P34059	522 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	MCM2	P49736	904 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	GPC5	P78333	572 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	PDCL	Q13371	301 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	SEC23B	Q15437	767 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	ETFDH	Q16134	617 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	DERA	Q9Y315	318 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	BCAR3	O75815	825 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	CD53	P19397	219 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	DUSP1	P28562	367 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	GRK5	P34947	590 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	JAK3	P52333	1124 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	CFHR3	Q02985	330 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	CPO	Q8IVL8	374 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	HERVK_113	Q902F9	699 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66

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