RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 MAP10Q9P2G4 905 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 DMTF1Q9Y222 760 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF510Q9Y2H8 683 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RAB19A4D1S5 217 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 GABBR2O75899 941 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SLC10A3P09131 477 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CLTBP09497 229 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM49P0CI25 452 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM49CP0CI26 452 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NCAM1P13591 858 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 VAMP7P51809 220 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PLTPP55058 493 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RAB4BP61018 213 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC74AQ0VAA2 488 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 OOSP2Q86WS3 158 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SPACA7Q96KW9 195 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 BCO2Q9BYV7 579 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SNX7Q9UNH6 387 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NFASCO94856 1347 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF541Q9H0D2 1346 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NR3C1P04150 777 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NTRK1P04629 796 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CYP1A2P05177 515 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 DBTP11182 482 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 HSD17B2P37059 387 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CD79BP40259 229 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 HADHAP40939 763 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RGS7P49802 495 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 HTRA3P83110 453 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CTXN3Q4LDR2 81 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC157Q569K6 752 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 MDH1BQ5I0G3 518 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NIPAL1Q6NVV3 410 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PTPRN2Q92932 1015 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 LURAP1Q96LR2 239 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CCSER1Q9C0I3 900 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 HMG20AQ9NP66 347 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 GCNT4Q9P109 453 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 MYMKA6NI61 221 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 H3BQF6 201 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 BTN3A1O00481 513 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF254O75437 659 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CCNKO75909 580 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 GTF2H1P32780 548 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 KDSRQ06136 332 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF235Q14590 738 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ACCSLQ4AC99 568 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 C4orf19Q8IY42 314 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ATAD1Q8NBU5 361 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NAT14Q8WUY8 206 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 STARD8Q92502 1023 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 KAT2BQ92831 832 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SLC29A1Q99808 456 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 C17orf80Q9BSJ5 609 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 HIPK3Q9H422 1215 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 FBXO44Q9H4M3 255 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC182A6NF36 153 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ATP9BO43861 1147 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 OR7A10O76100 309 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 BMP10O95393 424 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 POMCP01189 267 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RESTQ13127 1097 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PON2Q15165 354 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SFR1Q86XK3 245 aa6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms