RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 NFKBIZQ9BYH8 718 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 NEK6Q9HC98 313 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 NID2Q14112 1375 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 LAG3P18627 525 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 TRPC1P48995 793 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CLCN5P51795 746 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CRY2Q49AN0 593 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 WASHC2DQ5SRD0 308 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 MROH9Q5TGP6 573 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 LPCAT2Q7L5N7 544 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ADGRA1Q86SQ6 560 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 KSR1Q8IVT5 923 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ACTRT2Q8TDY3 377 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 TIFAQ96CG3 184 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 NT5MQ9NPB1 228 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 MYO1GB0I1T2 1018 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 H7C0S8 307 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SUPT7LO94864 414 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ADH1AP07327 375 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 KLK7P49862 253 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 RAD23AP54725 363 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 LY6KQ17RY6 165 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 USP41Q3LFD5 358 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 STRADAQ7RTN6 431 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SLC35C1Q96A29 364 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 TBC1D23Q9NUY8 699 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 PLIN4Q96Q06 1357 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ADGRA2Q96PE1 1338 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC189A1A4V9 331 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF286BP0CG31 522 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SOX6P35712 828 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 VGLL4Q14135 290 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CYTH1Q15438 398 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 FAM171A1Q5VUB5 890 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CES5AQ6NT32 575 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 GJB7Q6PEY0 223 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ZFP28Q8NHY6 868 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CENPTQ96BT3 561 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 MAGED4Q96JG8 741 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ADNPQ9H2P0 1102 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 THAP1Q9NVV9 213 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SYBUQ9NX95 663 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 NFAT5O94916 1531 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 MAGEA13PA6NCF6 341 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 URADA6NGE7 173 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 H0Y3Z8 333 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 FAM163BP0C2L3 166 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 TUBP50607 506 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 E2F4Q16254 413 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 HECTD3Q5T447 861 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 LRRC8DQ7L1W4 858 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 KCNMB4Q86W47 210 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SVOPQ8N4V2 548 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 KIAA0895Q8NCT3 520 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 DNAJC9Q8WXX5 260 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CNBD2Q96M20 576 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 FAM86B1E9PN63 330 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 FAM86B2P0C5J1 330 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 MMP13P45452 471 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 DSG1Q02413 1049 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CYP51A1Q16850 503 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 C11orf88Q6PI97 169 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ILDR2Q71H61 639 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 KDELC2Q7Z4H8 507 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SETD9Q8NE22 299 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 DLG3Q92796 817 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CNDP1Q96KN2 507 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC3Q9BQI4 270 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SAR1AQ9NR31 198 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ATAD3AQ9NVI7 634 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 MON2Q7Z3U7 1717 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SGTAO43765 313 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SP3Q02447 781 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 NOMO2Q5JPE7 1267 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF398Q8TD17 642 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 UGT2B28Q9BY64 529 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 EFR3BQ9Y2G0 817 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms