RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 EXOC4Q96A65 974 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 SERPINB11Q96P15 392 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 SMOC2Q9H3U7 446 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
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CS-215ENST00000549143 UBP1Q9NZI7 540 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 MARCH2Q9P0N8 246 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
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CS-215ENST00000549143 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
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CS-215ENST00000549143 SEC24AO95486 1093 aa8.67□□□□□ -1.02
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CS-215ENST00000549143 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
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CS-215ENST00000549143 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 C14orf80Q86SX3 495 aa8.67□□□□□ -1.02
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CS-215ENST00000549143 CFAP36Q96G28 342 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 SERPINB12Q96P63 405 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 OLFM3Q96PB7 478 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.022e-6■■□□□ 13.5
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CS-215ENST00000549143 CAPS2Q9BXY5 557 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 FAM107BQ9H098 131 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 NUP205Q92621 2012 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 XIRP2A4UGR9 3374 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 ZNF487B1APH4 448 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 ALOX15BO15296 676 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 TBC1D4O60343 1298 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 CAPN15O75808 1086 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 STK10O94804 968 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 CREB1P16220 341 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 PSMB4P28070 264 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 MAGEA11P43364 429 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 XRCC4Q13426 336 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 AUHQ13825 339 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 SLC8B1Q6J4K2 584 aa8.67□□□□□ -1.02
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CS-215ENST00000549143 CCDC77Q9BR77 488 aa8.67□□□□□ -1.02
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CS-215ENST00000549143 A0A0A0MRY4 1105 aa8.66□□□□□ -1.02
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CS-215ENST00000549143 URODP06132 367 aa8.66□□□□□ -1.02
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CS-215ENST00000549143 IRAK1P51617 712 aa8.66□□□□□ -1.02
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CS-215ENST00000549143 AIF1P55008 147 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.022e-6■■■□□ 17.3
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CS-215ENST00000549143 SPDYCQ5MJ68 293 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 KDELC2Q7Z4H8 507 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 CYP4X1Q8N118 509 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 ZNF567Q8N184 647 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 ZNF461Q8TAF7 563 aa8.66□□□□□ -1.02
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CS-215ENST00000549143 BADQ92934 168 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 SPATA13Q96N96 652 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 SPG21Q9NZD8 308 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 FRMPD3Q5JV73 1810 aa8.66□□□□□ -1.02
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CS-215ENST00000549143 E9PAM4 449 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 APOEP02649 317 aa8.66□□□□□ -1.02
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CS-215ENST00000549143 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 PIK3R6Q5UE93 754 aa8.66□□□□□ -1.02
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