RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549123.5

TCTN1-222, Transcript of tectonic family member 1, human

TSL 2

Gene TCTN1, Length 458 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCTN1-222	ENST00000549123	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	GPR150	Q8NGU9	434 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	PPTC7	Q8NI37	304 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	JADE3	Q92613	823 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	SPATA33	Q96N06	139 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	INTU	Q9ULD6	942 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	PARP14	Q460N5	1801 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	ELP1	O95163	1332 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	PLXNB2	O15031	1838 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	TBX3	O15119	743 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	MSH4	O15457	936 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	TDP2	O95551	362 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	MMP3	P08254	477 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	MYL3	P08590	195 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	CKB	P12277	381 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	SYT1	P21579	422 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	CDK7	P50613	346 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	ACLY	P53396	1101 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	SLC16A1	P53985	500 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	CTXN1	P60606	82 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	OCA2	Q04671	838 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	BECN1	Q14457	450 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	LETM2	Q2VYF4	491 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	FITM2	Q8N6M3	262 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	FAM20A	Q96MK3	541 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	SDF4	Q9BRK5	362 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	COL6A3	P12111	3177 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	GRIN2D	O15399	1336 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	ALG1L2	C9J202	215 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	HAS3	O00219	553 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	STX6	O43752	255 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	SLC37A4	O43826	429 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	PSMD10	O75832	226 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	PRSS23	O95084	383 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	GPANK1	O95872	356 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	MT-CO1	P00395	513 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	LGALS2	P05162	132 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	MYBL2	P10244	700 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	C5AR1	P21730	350 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	BMP5	P22003	454 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	FGFR4	P22455	802 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	SLC6A2	P23975	617 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	SFN	P31947	248 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	ACTR2	P61160	394 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	AMPD3	Q01432	767 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	CREM	Q03060	361 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	ITK	Q08881	620 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	ACAP2	Q15057	778 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TCTN1-222	ENST00000549123	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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