RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 CCDC42Q96M95 316 aa5.85□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 ACCSQ96QU6 501 aa5.85□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 PCYT2Q99447 389 aa5.85□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 TIPINQ9BVW5 301 aa5.85□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 SPATC1LQ9H0A9 340 aa5.85□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 WNT8AQ9H1J5 351 aa5.85□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 NELFAQ9H3P2 528 aa5.85□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 TXNRD2Q9NNW7 524 aa5.85□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 NLRC4Q9NPP4 1024 aa5.85□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa5.85□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 MKS1Q9NXB0 559 aa5.85□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 AIPL1Q9NZN9 384 aa5.85□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 MYO1AQ9UBC5 1043 aa5.85□□□□□ -1.47
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TRDN-205ENST00000546248 FBXO40Q9UH90 709 aa5.85□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 GUCA1BQ9UMX6 200 aa5.85□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 MRFAP1Q9Y605 127 aa5.85□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 GLTPD2A6NH11 291 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 TISP43B9A030 160 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 ANKRD63C9JTQ0 380 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 K7ENM7 598 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 SLC16A4O15374 487 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 PJA2O43164 708 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 KIF5CO60282 957 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 SERPING1P05155 500 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 EPB41P11171 864 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 CCND1P24385 295 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 MAGEA1P43355 309 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 VAV2P52735 878 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 PEX3P56589 373 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 SOX10P56693 466 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 PURAQ00577 322 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 PPIL2Q13356 520 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 ALCAMQ13740 583 aa5.84□□□□□ -1.47
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TRDN-205ENST00000546248 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 FAM102BQ5T8I3 360 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 SFMBT2Q5VUG0 894 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 GJB7Q6PEY0 223 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 OTUD6AQ7L8S5 288 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 ANKRD35Q8N283 1001 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa5.84□□□□□ -1.47
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TRDN-205ENST00000546248 OLIG1Q8TAK6 271 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 LMO3Q8TAP4 145 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 JAKMIP2Q96AA8 810 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 CDHR1Q96JP9 859 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 CEP170P1Q96L14 293 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 CBWD1Q9BRT8 395 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 TMEM206Q9H813 350 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 PRSS50Q9UI38 385 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 CDC23Q9UJX2 597 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 FBXL5Q9UKA1 691 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 NENFQ9UMX5 172 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa5.84□□□□□ -1.47
TRDN-205ENST00000546248 V9GYY5 206 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
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TRDN-205ENST00000546248 A0A087X1B8 175 aa5.83□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP5.83□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 MAFO75444 373 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 ARIH2O95376 493 aa5.83□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 SLC25A27O95847 323 aa5.83□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 RBP3P10745 1247 aa5.83□□□□□ -1.48
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TRDN-205ENST00000546248 ADSSP30520 456 aa5.83□□□□□ -1.48
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TRDN-205ENST00000546248 NPTX2P47972 431 aa5.83□□□□□ -1.48
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TRDN-205ENST00000546248 INHBCP55103 352 aa5.83□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 PPP3CAQ08209 521 aa5.83□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 TUBB2AQ13885 445 aa5.83□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 ACAP2Q15057 778 aa5.83□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 PPP2R5AQ15172 486 aa5.83□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 ELF2Q15723 593 aa5.83□□□□□ -1.48
TRDN-205ENST00000546248 EXOC3L4Q17RC7 722 aa5.83□□□□□ -1.48
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