RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF366	Q8N895	744 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	RSC1A1	Q92681	617 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	KAT2B	Q92831	832 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	TRMO	Q9BU70	441 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	SYT5	O00445	386 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	CYP3A4	P08684	503 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	TGM2	P21980	687 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	3.43	□□□□□ -1.86	5e-7	■■■□□ 15
MDM2-233	ENST00000545204	PGM5	Q15124	567 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	TWIST1	Q15672	202 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	PFKFB4	Q16877	469 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	BTBD16	Q32M84	506 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	AWAT2	Q6E213	333 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	GGT6	Q6P531	493 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	EXD3	Q8N9H8	876 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	ZBTB9	Q96C00	473 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	EID2B	Q96D98	161 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF347	Q96SE7	839 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	CRB3	Q9BUF7	120 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	MECR	Q9BV79	373 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	RAB21	Q9UL25	225 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204		A0A0G2JK05	382 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	UGDH	O60701	494 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	LARGE1	O95461	756 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	ITGA2B	P08514	1039 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	PEPD	P12955	493 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	ME1	P48163	572 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	SHC2	P98077	582 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	BRD3	Q15059	726 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	ZACN	Q401N2	412 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	MIDN	Q504T8	468 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	FAM47B	Q8NA70	645 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	ACKR2	O00590	384 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	TRIM38	O00635	465 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	WNT1	P04628	370 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	PSG1	P11464	419 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	GYS1	P13807	737 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	TNFRSF1B	P20333	461 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	CYP3A7	P24462	503 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	GRK5	P34947	590 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MDM2-233	ENST00000545204	SERPINF1	P36955	418 aa		3.41	□□□□□ -1.86

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