RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539921.5

SNHG1-211, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG1, Length 1,071 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-211ENST00000539921 LY9Q9HBG7 655 aa6.3□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.3□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.3□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.3□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 OLAHQ9NV23 265 aa6.3□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 B3GNT2Q9NY97 397 aa6.3□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 FNIP2Q9P278 1114 aa6.3□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.3□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.3□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 VPS51Q9UID3 782 aa6.3□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF221Q9UK13 617 aa6.3□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.3□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.3□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.3□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 AUP1Q9Y679 476 aa6.3□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 STON1Q9Y6Q2 735 aa6.3□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 A3GALT2U3KPV4 340 aa6.3□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 USP54Q70EL1 1684 aa6.3□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 LAMB4A4D0S4 1761 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 PI4KAP2A4QPH2 592 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF487B1APH4 448 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 H0Y858 1186 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 I3L4J1 428 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 CCRL2O00421 344 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 EML1O00423 815 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 SNPHO15079 494 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 TP73O15350 636 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 DFNA5O60443 496 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 SERPINI2O75830 405 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 SNX4O95219 450 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 ACSL3O95573 720 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 IFNA14P01570 189 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 MYL2P10916 166 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 KRT13P13646 458 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 KCNA6P17658 529 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 COL9A1P20849 921 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 MYF6P23409 242 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 F8A1P23610 371 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 IVDP26440 423 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 AXLP30530 894 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 UGT2B10P36537 528 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 CASP3P42574 277 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 BTDP43251 543 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 POLD2P49005 469 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 NDST1P52848 882 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 NDST2P52849 883 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 ARL4CP56559 192 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 KCNQ4P56696 695 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 AP3B2Q13367 1082 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 TAF5Q15542 800 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 CCNG2Q16589 344 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 RTN1Q16799 776 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 TYSND1Q2T9J0 566 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 YIF1BQ5BJH7 314 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 DCAF12L1Q5VU92 463 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 AGAP6Q5VW22 663 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 IYDQ6PHW0 289 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 ARCQ7LC44 396 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 RETREG3Q86VR2 466 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 WDR49Q8IV35 697 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 GLG1Q92896 1179 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 NCLNQ969V3 563 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 SH3KBP1Q96B97 665 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 ERLEC1Q96DZ1 483 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 MAP6Q96JE9 813 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF560Q96MR9 790 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 AGAP4Q96P64 663 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 BBS4Q96RK4 519 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 APOL5Q9BWW9 433 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 SLC26A6Q9BXS9 759 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 TRIM31Q9BZY9 425 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 TRIM9Q9C026 710 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 NANOGQ9H9S0 305 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 CABP5Q9NP86 173 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 TIGARQ9NQ88 270 aa6.29□□□□□ -1.4
SNHG1-211ENST00000539921 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms