RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535811.1

PARPBP-208, Transcript of PARP1 binding protein, human

TSL 2

Gene PARPBP, Length 1,465 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PARPBP-208	ENST00000535811	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	C18orf8	Q96DM3	657 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	GPR78	Q96P69	363 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	SPTLC2	O15270	562 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	WNT1	P04628	370 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	CYP3A4	P08684	503 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	TGM2	P21980	687 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	GRM4	Q14833	912 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	DLGAP5	Q15398	846 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	LIPM	Q5VYY2	423 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	TTC3	P53804	2025 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811		B4DGG1	531 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	CNTN5	O94779	1100 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	KAT7	O95251	611 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	CDK7	P50613	346 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	NEK3	P51956	506 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	SLC37A1	P57057	533 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	FOXL2	P58012	376 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	P3H1	Q32P28	736 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	DHRS13	Q6UX07	377 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	MARK4	Q96L34	752 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	CER1	O95813	267 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	SCP2	P22307	547 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	CYP3A7	P24462	503 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	THBS3	P49746	956 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	SRL	Q86TD4	932 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	EID2B	Q96D98	161 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	TNIP3	Q96KP6	325 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	UGDH	O60701	494 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	ABCB4	P21439	1286 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	TAS2R50	P59544	299 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	NPAS1	Q99742	590 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	CHST12	Q9NRB3	414 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811		H3BNX3	289 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PARPBP-208	ENST00000535811	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65

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