RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533012.1

TRAPPC4-211, Transcript of trafficking protein particle complex 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC4, Length 817 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4-211ENST00000533012 LACRTQ9GZZ8 138 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 PLK2Q9NYY3 685 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 STIM2Q9P246 746 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 DEC1Q9P2X7 70 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 OR12D3Q9UGF7 316 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 VANGL2Q9ULK5 521 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 FZD10Q9ULW2 581 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa11.62□□□□□ -0.55
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TRAPPC4-211ENST00000533012 KRBA1A5PL33 1030 aa11.61□□□□□ -0.55
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TRAPPC4-211ENST00000533012 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
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TRAPPC4-211ENST00000533012 C14orf80Q86SX3 495 aa11.61□□□□□ -0.55
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TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 CD101Q93033 1021 aa11.61□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 PNKPQ96T60 521 aa11.61□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 P2RY13Q9BPV8 354 aa11.61□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 SLC2A11Q9BYW1 496 aa11.61□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 MFSD1Q9H3U5 465 aa11.61□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 SNX10Q9Y5X0 201 aa11.61□□□□□ -0.55
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TRAPPC4-211ENST00000533012 E9PAM4 449 aa11.6□□□□□ -0.55
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TRAPPC4-211ENST00000533012 KRT86O43790 486 aa11.6□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 CACNG3O60359 315 aa11.6□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 TULP3O75386 442 aa11.6□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 CD72P21854 359 aa11.6□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 L1CAMP32004 1257 aa11.6□□□□□ -0.55
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TRAPPC4-211ENST00000533012 OPRD1P41143 372 aa11.6□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 SLC6A11P48066 632 aa11.6□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 RPS24P62847 133 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
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TRAPPC4-211ENST00000533012 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 PON2Q15165 354 aa11.6□□□□□ -0.55
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TRAPPC4-211ENST00000533012 C5orf22Q49AR2 442 aa11.6□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa11.6□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
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TRAPPC4-211ENST00000533012 CARNMT1Q8N4J0 409 aa11.6□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 IGSF8Q969P0 613 aa11.6□□□□□ -0.55
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TRAPPC4-211ENST00000533012 ZWILCHQ9H900 591 aa11.6□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 SALL4Q9UJQ4 1053 aa11.6□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 FBXO10Q9UK96 956 aa11.6□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 AP4E1Q9UPM8 1137 aa11.6□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 ALG6Q9Y672 507 aa11.6□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa11.59□□□□□ -0.55
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TRAPPC4-211ENST00000533012 MACROD2A1Z1Q3 448 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 TMEM221A6NGB7 291 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 FAM170BA6NMN3 283 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 H0Y626 953 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 M0R296 226 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 NCAM2O15394 837 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 SPOPO43791 374 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 CREB3O43889 395 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 CLDN11O75508 207 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 APODP05090 189 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 KRT7P08729 469 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 RARAP10276 462 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 DRD1P21728 446 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 COMTP21964 271 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 IL1R2P27930 398 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 GRIA2P42262 883 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 DGKGP49619 791 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 SGSHP51688 502 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 CDH4P55283 916 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 CDH18Q13634 790 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 KCNT1Q5JUK3 1230 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 GRAMD4Q6IC98 578 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 TXNDC11Q6PKC3 985 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF662Q6ZS27 426 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 CHST9Q7L1S5 443 aa11.59□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 DAAM2Q86T65 1068 aa11.59□□□□□ -0.55
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