RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531691.5

TXNRD1-223, Transcript of thioredoxin reductase 1, human

TSL 2

Gene TXNRD1, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TXNRD1-223	ENST00000531691	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	GGA2	Q9UJY4	613 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	FZD4	Q9ULV1	537 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMEM131	Q92545	1883 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	CLIC2	O15247	247 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	EXOC3	O60645	756 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	MPO	P05164	745 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	PROX2	Q3B8N5	592 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	SGO2	Q562F6	1265 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	TAF4B	Q92750	862 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	PANK2	Q9BZ23	570 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	ABCG4	Q9H172	646 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	SDCBP2	Q9H190	292 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	EBF2	Q9HAK2	575 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	USP3	Q9Y6I4	520 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TXNRD1-223	ENST00000531691	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691		A0A1W2PP55	124 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	TGFB1I1	O43294	461 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	SIGLEC6	O43699	453 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	USP12	O75317	370 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLFN14	P0C7P3	912 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	HOXD13	P35453	343 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	AMPD3	Q01432	767 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	OVGP1	Q12889	678 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	CST6	Q15828	149 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	ADGRF1	Q5T601	910 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	IQCH	Q86VS3	1027 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	HPS3	Q969F9	1004 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	DUSP16	Q9BY84	665 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	UBE4B	O95155	1302 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691		K7ENP7	123 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	MID1	O15344	667 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	OPA1	O60313	960 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	GOT1	P17174	413 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC8A1	P32418	973 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	NUDT1	P36639	197 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	CASP4	P49662	377 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC8A3	P57103	927 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	ASIC1	P78348	528 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	NFATC3	Q12968	1075 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	KCNJ12	Q14500	433 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	XKR5	Q6UX68	686 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	CLIC6	Q96NY7	704 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	TNMD	Q9H2S6	317 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	MYH10	P35580	1976 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRIM38	O00635	465 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	WNT9A	O14904	365 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	SIN3B	O75182	1162 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	CS	O75390	466 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	LATS1	O95835	1130 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	ASL	P04424	464 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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