RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527265.1

CLNS1A-208, Transcript of chloride nucleotide-sensitive channel 1A, human

TSL 2

Gene CLNS1A, Length 620 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLNS1A-208	ENST00000527265	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	PIP5K1A	Q99755	562 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	MYOC	Q99972	504 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	MECR	Q9BV79	373 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	OPA3	Q9H6K4	179 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	HPF1	Q9NWY4	346 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265		A0A0U1RQK1	487 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	ZNF320	A2RRD8	509 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	LIPT2	A6NK58	231 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265		H0YAE9	185 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	PSMA7	O14818	248 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	TULP3	O75386	442 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	ALDH1A2	O94788	518 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	PDE8B	O95263	885 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	CER1	O95813	267 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	GAST	P01350	101 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	TPM2	P07951	284 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	RAP2A	P10114	183 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	RARG	P13631	454 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	KRT2	P35908	639 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	GP5	P40197	560 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	MEOX1	P50221	254 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	HSD17B4	P51659	736 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	DGCR2	P98153	550 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	COASY	Q13057	564 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	TNFAIP1	Q13829	316 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	LRRC24	Q50LG9	513 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	RAB41	Q5JT25	222 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	AFMID	Q63HM1	303 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	ADAL	Q6DHV7	355 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	GLRX5	Q86SX6	157 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	USP37	Q86T82	979 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	PDSS2	Q86YH6	399 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	KRT35	Q92764	455 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	GBP5	Q96PP8	586 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	AGAP2	Q99490	1192 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	PRRX2	Q99811	253 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	MROH8	Q9H579	483 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLNS1A-208	ENST00000527265	JKAMP	Q9P055	326 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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