RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 LAYNQ6UX15 382 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRU-210ENST00000527027 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
PTPRU-210ENST00000527027 SCUBE3Q8IX30 993 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRU-210ENST00000527027 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
PTPRU-210ENST00000527027 KCTD13Q8WZ19 329 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRU-210ENST00000527027 EEF2KMTQ96G04 330 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRU-210ENST00000527027 ORAI3Q9BRQ5 295 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRU-210ENST00000527027 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
PTPRU-210ENST00000527027 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRU-210ENST00000527027 PTPRBP23467 1997 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 FAM149AA5PLN7 773 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 EPB41P11171 864 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 SGSHP51688 502 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 NDUFA8P51970 172 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 RACK1P63244 317 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 INAVAQ3KP66 663 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 CCDC157Q569K6 752 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 PIK3R6Q5UE93 754 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 KIAA0895LQ68EN5 471 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 USP30Q70CQ3 517 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 SCML4Q8N228 414 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 UBA3Q8TBC4 463 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 CNGB3Q9NQW8 809 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 KIAA1257Q9ULG3 409 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 SCML1Q9UN30 329 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 BPTFQ12830 3046 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 A0A087WV48 116 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 E9PAM4 449 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 CETN3O15182 167 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 VILLO15195 856 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 IRAK2O43187 625 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 MSI1O43347 362 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 TBL1XO60907 577 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 IGHV4-34P06331 123 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 SETSIPP0DME0 302 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 VDRP11473 427 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 CD19P15391 556 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 CD70P32970 193 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 SLC11A2P49281 568 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 C21orf59P57076 290 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 DAOAP59103 153 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 CUL2Q13617 745 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 RFWD3Q6PCD5 774 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 DHRS13Q6UX07 377 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 TMPRSS12Q86WS5 348 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 UNC45BQ8IWX7 931 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 WFDC5Q8TCV5 224 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 GANCQ8TET4 914 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 SPATA32Q96LK8 384 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 FTSJ1Q9UET6 329 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 COQ4Q9Y3A0 265 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 KNTC1P50748 2209 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 A0A1B0GTQ1 180 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 O00370 1275 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 IGLV3-27P01718 113 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 LCP1P13796 627 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 GALCP54803 685 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 ST8SIA6P61647 398 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 IL9RQ01113 521 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 CBWD6Q4V339 395 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 PKDCCQ504Y2 493 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 CBWD3Q5JTY5 395 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 CBWD5Q5RIA9 395 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 MSANTD2Q6P1R3 559 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 KRBA2Q6ZNG9 492 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 HSCBQ8IWL3 235 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 FIBINQ8TAL6 211 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 AZIN2Q96A70 460 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 TTC17Q96AE7 1141 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 SKA1Q96BD8 255 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 MYO19Q96H55 970 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 LMLNQ96KR4 655 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 MTG2Q9H4K7 406 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 FBXL12Q9NXK8 326 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 A0A1W2PPC4 97 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 FAM47DPA6NHR8 397 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 ACSL4O60488 711 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 SLC6A4P31645 630 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 TCERG1LQ5VWI1 586 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 NUGGCQ68CJ6 796 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 MFN1Q8IWA4 741 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 IRGQQ8WZA9 623 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-210ENST00000527027 STIM2Q9P246 746 aa16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms