RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524356.1

PCM1-223, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 2

Gene PCM1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-223	ENST00000524356	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	RFFL	Q8WZ73	363 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	FBXL20	Q96IG2	436 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	C7orf26	Q96N11	449 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	KIF1B	O60333	1816 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ADM5	C9JUS6	153 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	MUT	P22033	750 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	HK3	P52790	923 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SNX16	P57768	344 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	MALL	Q13021	153 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	DLGAP5	Q15398	846 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ADRM1	Q16186	407 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356		Q8NA96	180 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	HDAC10	Q969S8	669 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SNX21	Q969T3	373 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	HMCES	Q96FZ2	354 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	GDF15	Q99988	308 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	VPS33B	Q9H267	617 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	PREB	Q9HCU5	417 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	TMEM160	Q9NX00	188 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	USP6	P35125	1406 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356		H3BUI4	141 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	PODXL	O00592	558 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SLC16A6	O15403	523 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	TOMM70	O94826	608 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SGPL1	O95470	568 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	CD1A	P06126	327 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ADRB2	P07550	413 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ITGA5	P08648	1049 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	RARB	P10826	455 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	PSMA3	P25788	255 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	CASP6	P55212	293 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	BPIFB3	P59826	476 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	BECN1	Q14457	450 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	TSPYL6	Q8N831	410 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ARL10	Q8N8L6	244 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	VMP1	Q96GC9	406 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	MRI1	Q9BV20	369 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	KRT84	Q9NSB2	600 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SCOC	Q9UIL1	159 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	IFT172	Q9UG01	1749 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ADGRB1	O14514	1584 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PCM1-223	ENST00000524356	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PCM1-223	ENST00000524356	TRIM64B	A6NI03	449 aa		4.71	□□□□□ -1.66

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