RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520462.5

TSNARE1-206, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSNARE1, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-206ENST00000520462 PRKCIP41743 596 aa16■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 ZBED6P86452 979 aa16■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 MESP2Q0VG99 397 aa16■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 DMC1Q14565 340 aa16■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC25A52Q3SY17 297 aa16■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 PIK3R6Q5UE93 754 aa16■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 ACAD10Q6JQN1 1059 aa16■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 SYT13Q7L8C5 426 aa16■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 VPS36Q86VN1 386 aa16■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 CCDC33Q8N5R6 958 aa16■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 UCMAQ8WVF2 138 aa16■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 GAB3Q8WWW8 586 aa16■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 NPY6RQ99463 290 aa16■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 STIM2Q9P246 746 aa16■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 CAPN11Q9UMQ6 739 aa16■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa16■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 TMCO5BA8MYB1 307 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 F5H5T6 163 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 CISD3P0C7P0 127 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 KRT3P12035 628 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 TACR2P21452 398 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC6A4P31645 630 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 FLT3P36888 993 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 TRIM14Q14142 442 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 E2F5Q15329 346 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 EOGTQ5NDL2 527 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 BRMS1LQ5PSV4 323 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 MPP7Q5T2T1 576 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 RAP1GAP2Q684P5 730 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 IL31Q6EBC2 164 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 NADSYN1Q6IA69 706 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 SDE2Q6IQ49 451 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 DNAJC24Q6P3W2 148 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 ARCQ7LC44 396 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 KBTBD6Q86V97 674 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 SFTPA1Q8IWL2 248 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 LGI2Q8N0V4 545 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 KCNV2Q8TDN2 545 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 HHIPQ96QV1 700 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 TBCBQ99426 244 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 WDCPQ9H6R7 721 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 TMEM59LQ9UK28 342 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 FBXO10Q9UK96 956 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 MMP17Q9ULZ9 603 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 ADRB1P08588 477 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 SKILP12757 684 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 PDGFRAP16234 1089 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 DESP17661 470 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 SDC4P31431 198 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 GSCP56915 257 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 PTP4A2Q12974 167 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 MS4A13Q5J8X5 152 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 RABGAP1LQ5R372 815 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 EMC10Q5UCC4 262 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 MON1BQ7L1V2 547 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 CAMKK1Q8N5S9 505 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 ALLCQ8N6M5 410 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 EMC1Q8N766 993 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 C3orf20Q8ND61 904 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 RXFP2Q8WXD0 754 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 CFAP57Q96MR6 1250 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 PIGVQ9NUD9 493 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 CACNA1GO43497 2377 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 PRRT4C9JH25 899 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 GFRA2O00451 464 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 GYPCP04921 128 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 SERPING1P05155 500 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 CASP14P31944 242 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 RDXP35241 583 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 SGSHP51688 502 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 ATP11AP98196 1134 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 CDH18Q13634 790 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 CDO1Q16878 200 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms