RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507965.5

ATXN3-210, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 2

Gene ATXN3, Length 708 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-210ENST00000507965 PMS2CLQ68D20 193 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 SLFN12LQ6IEE8 588 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 ANO7Q6IWH7 933 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 FAM173BQ6P4H8 233 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 TTC30AQ86WT1 665 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 CCDC33Q8N5R6 958 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 CAMKK1Q8N5S9 505 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 LRRC52Q8N7C0 313 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 FRMD1Q8N878 549 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 TSTD1Q8NFU3 115 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 OR5B17Q8NGF7 314 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 USP33Q8TEY7 942 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 HPS3Q969F9 1004 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 DNAJC19Q96DA6 116 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 CLIC6Q96NY7 704 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 SYT15Q9BQS2 421 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 ACBD6Q9BR61 282 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 LINC00597Q9H2U6 94 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 C12orf49Q9H741 205 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 TMEM206Q9H813 350 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 CRTAC1Q9NQ79 661 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 TMEM30AQ9NV96 361 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 ITGA11Q9UKX5 1188 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 SMC3Q9UQE7 1217 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa5.91□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 ASPMQ8IZT6 3477 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 SDK1Q7Z5N4 2213 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 PTPRBP23467 1997 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 C4orf47A7E2U8 309 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 LEFTY2O00292 366 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 GABRDO14764 452 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 CAVIN2O95810 425 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 TMEM191BP0C7N4 346 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 IDEP14735 1019 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 BMP6P22004 513 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 BDNFP23560 247 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 LMO2P25791 158 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 ABCD1P33897 745 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 LRRC14Q15048 493 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 FBXO43Q4G163 708 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 RALGPS1Q5JS13 557 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 KIAA1211LQ6NV74 962 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 BRAPQ7Z569 592 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 RASSF3Q86WH2 238 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 CBWD2Q8IUF1 395 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 TMEM86AQ8N2M4 240 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 ALLCQ8N6M5 410 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 MFSD2AQ8NA29 543 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 RLN3Q8WXF3 142 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 UBXN4Q92575 508 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 PCED1BQ96HM7 432 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 ACCSQ96QU6 501 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 DPEP3Q9H4B8 488 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 FSCN3Q9NQT6 498 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 SMPD4Q9NXE4 827 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 GDAP2Q9NXN4 497 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 EBF1Q9UH73 591 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 ZMYM5Q9UJ78 669 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 TMEM59LQ9UK28 342 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 WASF3Q9UPY6 502 aa5.9□□□□□ -1.46
ATXN3-210ENST00000507965 AKAP13Q12802 2813 aa5.89□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 SPEGQ15772 3267 aa5.89□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa5.89□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 FRMD3A2A2Y4 597 aa5.89□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 F8VP50 259 aa5.89□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 SGK1O00141 431 aa5.89□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 CLDN5O00501 218 aa5.89□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 RHOBTB1O94844 696 aa5.89□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 NFATC1O95644 943 aa5.89□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 OLFM2O95897 454 aa5.89□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 BMP15O95972 392 aa5.89□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 OAS1P00973 400 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 PROS1P07225 676 aa5.89□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 PDGFRBP09619 1106 aa5.89□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 GAP43P17677 238 aa5.89□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 HDCP19113 662 aa5.89□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 GARTP22102 1010 aa5.89□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 PCSK1P29120 753 aa5.89□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 HOXD13P35453 343 aa5.89□□□□□ -1.47
ATXN3-210ENST00000507965 STAT6P42226 847 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms