RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1B0GVM2 712 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 TCAF2A6NFQ2 919 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 GFRA2O00451 464 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 TSPAN3O60637 253 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 PAGE1O75459 146 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 CYP1A2P05177 515 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM253P0C7T8 217 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 ADRA1BP35368 520 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 GALCP54803 685 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 CDH18Q13634 790 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 EFHC2Q5JST6 749 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 EOGTQ5NDL2 527 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 RAP1GAP2Q684P5 730 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 SLFN11Q7Z7L1 901 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 C1orf210Q8IVY1 113 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 MFN1Q8IWA4 741 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 AHI1Q8N157 1196 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 NAT16Q8N8M0 369 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM105Q8N8V8 129 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 FIBINQ8TAL6 211 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 CHFRQ96EP1 664 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 MYO1AQ9UBC5 1043 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 FBXO4Q9UKT5 387 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 F5P12259 2224 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 SHISA7A6NL88 538 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 H0Y626 953 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 PI15O43692 258 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 PCK1P35558 622 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 CXCL12P48061 93 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC6A11P48066 632 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 VCPP55072 806 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 CDH4P55283 916 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 SCAPQ12770 1279 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 AUHQ13825 339 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 CDO1Q16878 200 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 GAB4Q2WGN9 574 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 C5orf22Q49AR2 442 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 NADSYN1Q6IA69 706 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 SCYL2Q6P3W7 929 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 CHST9Q7L1S5 443 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 OLIG1Q8TAK6 271 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 CHP1Q99653 195 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 SIK2Q9H0K1 926 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 THAP2Q9H0W7 228 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 STIM2Q9P246 746 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 PLA2G4CQ9UP65 541 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC8A2Q9UPR5 921 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 MUC3AQ02505 3323 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 CCP110O43303 1012 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 PRPSAP2O60256 369 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 ALDH1A2O94788 518 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 EGFP01133 1207 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 ASLP04424 464 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 CISD3P0C7P0 127 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC6A4P31645 630 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 ETFBP38117 255 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 ARHGAP25P42331 645 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 PTPN5P54829 565 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 KDSRQ06136 332 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 SULT2A1Q06520 285 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 FZD5Q13467 585 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 HADHQ16836 314 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF528Q3MIS6 628 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 BOLA3Q53S33 107 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 RNF43Q68DV7 783 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 FBXL22Q6P050 247 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 RFWD3Q6PCD5 774 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM131BQ86XD5 332 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 CAMKK1Q8N5S9 505 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 BHMTQ93088 406 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 PLK2Q9NYY3 685 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 OR12D3Q9UGF7 316 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 HS3ST4Q9Y661 456 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-208ENST00000504294 COL4A2P08572 1712 aa15.02□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 DRGXA6NNA5 263 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 K7EQS6 105 aa15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms