RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497675.2

FAAP20-214, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 4,478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-214ENST00000497675 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 GPR1P46091 355 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 POU4F1Q01851 419 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 MFSD5Q6N075 450 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 HTR3CQ8WXA8 447 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 AUTS2Q8WXX7 1259 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 MS4A14Q96JA4 679 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 TRIM51Q9BSJ1 452 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 A0A1W2PQH9 124 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 KCNA5P22460 613 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 POM121L1PQ3SYA9 428 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 HERVK_113Q902F9 699 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 KAT2BQ92831 832 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 MAN1C1Q9NR34 630 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 PTPRJQ12913 1337 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 ALS2Q96Q42 1657 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 SNED1Q8TER0 1413 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 LRRC72A6NJI9 287 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 GDI1P31150 447 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 HIC1Q14526 733 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 TAPT1Q6NXT6 567 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 OTOAQ7RTW8 1153 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 BCAS4Q8TDM0 211 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 PANX3Q96QZ0 392 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 L1RE1Q9UN81 338 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 NWD2Q9ULI1 1742 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 KLRC4O43908 158 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 CDH16O75309 829 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 RB1P06400 928 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 TEAD4Q15561 434 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 IL17AQ16552 155 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 C11orf96Q7Z7L8 435 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP15.04■□□□□ -01e-8■■■■■ 81.6
FAAP20-214ENST00000497675 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 OSGEPQ9NPF4 335 aa15.04■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 SDK1Q7Z5N4 2213 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 HACD1B0YJ81 288 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 ENPP3O14638 875 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 DAB1O75553 588 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 GJA5P36382 358 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 GGCXP38435 758 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 LPIN1Q14693 890 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 CCDC197Q8NCU1 140 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 IRF7Q92985 503 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 KCTD10Q9H3F6 313 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 TRIM10Q9UDY6 481 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 FBXL5Q9UKA1 691 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 GRM3Q14832 879 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 RAET1GQ6H3X3 334 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 C4orf32Q8N8J7 132 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 E2F7Q96AV8 911 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 MYOCQ99972 504 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 NDOR1Q9UHB4 597 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 L3MBTL1Q9Y468 752 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 YIPF1Q9Y548 306 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 ATG13O75143 517 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 PPFIA2O75334 1257 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 AGAP9Q5VTM2 703 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 LCLAT1Q6UWP7 414 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 RRM2BQ7LG56 351 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 TMEM192Q8IY95 271 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 GLMNQ92990 594 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 CXorf40BQ96DE9 158 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 FEM1CQ96JP0 617 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 NLNQ9BYT8 704 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 PITPNM3Q9BZ71 974 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 STARD13Q9Y3M8 1113 aa15.03■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 ATP8B1O43520 1251 aa15.02■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 DIAPH2O60879 1101 aa15.02■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 TIMP1P01033 207 aa15.02■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 MAGEA4P43358 317 aa15.02■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP15.02■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 POU6F1Q14863 301 aa15.02■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 C11orf63Q6NUN7 778 aa15.02■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 LRRC55Q6ZSA7 311 aa15.02■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 SYTL1Q8IYJ3 562 aa15.02■□□□□ -0
FAAP20-214ENST00000497675 SPATA20Q8TB22 786 aa15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms