RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	CALCRL	Q16602	461 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	UGT8	Q16880	541 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ANKS6	Q68DC2	871 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	RDM1	Q8NG50	284 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	NDC1	Q9BTX1	674 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TSPY26P	Q9H489	355 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	COL1A2	P08123	1366 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	MAGEB2	O15479	319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	BRINP1	O60477	761 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	NEMF	O60524	1076 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	DTNB	O60941	627 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ULK1	O75385	1050 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	PRKD3	O94806	890 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CCNE2	O96020	404 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CKB	P12277	381 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ENPP1	P22413	925 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ITGB8	P26012	769 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SESN3	P58005	492 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	PSMC5	P62195	406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ITK	Q08881	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SHH	Q15465	462 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	NPY5R	Q15761	445 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF365	Q70YC5	407 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	C14orf80	Q86SX3	495 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SERINC5	Q86VE9	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	NME8	Q8N427	588 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	METTL13	Q8N6R0	699 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ERMN	Q8TAM6	284 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SEPT8	Q92599	483 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	MBOAT7	Q96N66	472 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	NEU1	Q99519	415 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	PANK2	Q9BZ23	570 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	RAB34	Q9BZG1	259 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SYBU	Q9NX95	663 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	LAD1	O00515	517 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF185	O15231	689 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SLC37A4	O43826	429 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	PSMD10	O75832	226 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	BAIAP3	O94812	1187 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TYRP1	P17643	537 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	KLRC1	P26715	233 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	GPR15	P49685	360 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	NRG3	P56975	720 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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