RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490322.1

SMYD3-215, Transcript of SET and MYND domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMYD3, Length 368 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3-215ENST00000490322 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 NT5C1BQ96P26 610 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 PLCD4Q9BRC7 762 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 REEP2Q9BRK0 252 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 LXNQ9BS40 222 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 SYT17Q9BSW7 474 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 TEX13BQ9BXU2 312 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 MAGEH1Q9H213 219 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 ADAMTS10Q9H324 1103 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 ACAD9Q9H845 621 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 PCDH18Q9HCL0 1135 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 PXMP2Q9NR77 195 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 TBC1D22BQ9NU19 505 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 TMEM140Q9NV12 185 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 RGL1Q9NZL6 768 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 TBC1D7Q9P0N9 293 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 COL20A1Q9P218 1284 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 SEL1LQ9UBV2 794 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 GPR160Q9UJ42 338 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 ODF2LQ9ULJ1 636 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 FZD1Q9UP38 647 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 SIT1Q9Y3P8 196 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa3.06□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 PFASO15067 1338 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 UQCRHLA0A096LP55 91 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 FRMD3A2A2Y4 597 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 ARHGEF35A5YM69 484 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 LRRC14BA6NHZ5 514 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 USP27XA6NNY8 438 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 CLCA1A8K7I4 914 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 RSPH10B2B2RC85 870 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 B4DLN1 442 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 ACKR2O00590 384 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 PODXLO00592 558 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 PDXKO00764 312 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 ATP2A1O14983 1001 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 CETN3O15182 167 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 DAPK3O43293 454 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 CALUO43852 315 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 TBC1D4O60343 1298 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 SNX2O60749 519 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.922e-6■■■■■ 46.6
SMYD3-215ENST00000490322 TMEM127O75204 238 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 GPR32O75388 356 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 STAM2O75886 525 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 BAIAP3O94812 1187 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 SLITRK3O94933 977 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 INMTO95050 263 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 GCNT3O95395 438 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 GNA14O95837 355 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 LRG1P02750 347 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 TUBB4AP04350 444 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 GYPCP04921 128 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 MPOP05164 745 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 UQCRHP07919 91 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 CCDC175P0C221 793 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 RSPH10BP0C881 870 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 CTSSP25774 331 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 KLRC1P26715 233 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 CASP14P31944 242 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 SFNP31947 248 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 ELF1P32519 619 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 EPHX2P34913 555 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 QARSP47897 775 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 RXRGP48443 463 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 KCNJ5P48544 419 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 JAK3P52333 1124 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 HK2P52789 917 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 PSMC6P62333 389 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 MXRA7P84157 204 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 PFKPQ01813 784 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 TLE1Q04724 770 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 PPATQ06203 517 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 KRTAP1-1Q07627 177 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 GOLGA8FQ08AF8 430 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa3.05□□□□□ -1.92
SMYD3-215ENST00000490322 PRKG2Q13237 762 aa3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms