RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB33A	Q14088	237 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	TRADD	Q15628	312 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	SV2C	Q496J9	727 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	C2CD6	Q53TS8	623 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	CFAP58	Q5T655	872 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	TTC30A	Q86WT1	665 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	ATL2	Q8NHH9	583 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	TEKT4	Q8WW24	435 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	ART4	Q93070	314 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	HSFY1	Q96LI6	401 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	TBCB	Q99426	244 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	FMO2	Q99518	471 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	CNPY3	Q9BT09	278 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	ST7	Q9NRC1	585 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	GMIP	Q9P107	970 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	HES2	Q9Y543	173 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	MYH10	P35580	1976 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A0U1RQF3	1178 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247		A6NNZ2	444 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247		M0QYV0	167 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	MDM4	O15151	490 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	LIAS	O43766	372 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	HSF2BP	O75031	334 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	TJP3	O95049	919 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	GJB6	O95452	261 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	GAS8	O95995	478 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	PGK1	P00558	417 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	ASGR1	P07306	291 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	ACR	P10323	421 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	RALA	P11233	206 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	FGFR1	P11362	822 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	RARG	P13631	454 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	KLRC2	P26717	231 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	MAP2K2	P36507	400 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	HSD17B3	P37058	310 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	ACADSB	P45954	432 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	OXCT1	P55809	520 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	SLMAP	Q14BN4	828 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC142	Q17RM4	750 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	BBS12	Q6ZW61	710 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	BNIPL	Q7Z465	357 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	CROCCP2	Q86T23	111 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	CDH24	Q86UP0	819 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	SCML4	Q8N228	414 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	BBOF1	Q8ND07	529 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM13C	Q8NE31	585 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	IFT81	Q8WYA0	676 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATG4A-208	ENST00000489247	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		5.79	□□□□□ -1.48

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