RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485067.1

USP16-206, Transcript of ubiquitin specific peptidase 16, humanhuman

TSL 2

Gene USP16, Length 2,259 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16-206ENST00000485067 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 SIKE1Q9BRV8 207 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 HGH1Q9BTY7 390 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 BCO2Q9BYV7 579 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 NUF2Q9BZD4 464 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 KLHL4Q9C0H6 718 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 L3MBTL1Q9Y468 752 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 SIGLEC16A6NMB1 481 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 NPPAP01160 153 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 GJC1P36383 396 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 ASMTP46597 345 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 VCPP55072 806 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 OSTNP61366 133 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 TTLL4Q14679 1199 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 NR1D2Q14995 579 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 HADHQ16836 314 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 FAM187BQ17R55 369 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 FBXO43Q4G163 708 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 ZNF667Q5HYK9 610 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 ZNF484Q5JVG2 852 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 MFSD7Q6UXD7 560 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 GATAD2AQ86YP4 633 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 WDTC1Q8N5D0 677 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 TTC13Q8NBP0 860 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 ANKRD27Q96NW4 1050 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 TTC1Q99614 292 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 RNPEPQ9H4A4 650 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 MINDY3Q9H8M7 445 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa9.51□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 DNAH12Q6ZR08 3092 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 DPPA5A6NC42 116 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 ASB14A6NK59 587 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 NOTOA8MTQ0 251 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 F8VP50 259 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 GJB6O95452 261 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 WEE2P0C1S8 567 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 IQCF3P0C7M6 154 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 MCF2P10911 925 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 P4HA1P13674 534 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 CDKN2BP42772 138 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 MAGEA4P43358 317 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 PHKA2P46019 1235 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 VPS41P49754 854 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 CLCN3P51790 818 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 DAB2P98082 770 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 MBTD1Q05BQ5 628 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 OASLQ15646 514 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 MOGQ16653 247 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 EFCAB12Q6NXP0 572 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 ZER1Q7Z7L7 766 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 TMEM192Q8IY95 271 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 CCDC13Q8IYE1 715 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 THNSL1Q8IYQ7 743 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 PPFIBP2Q8ND30 876 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 CCT6BQ92526 530 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 ZNF570Q96NI8 536 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 CYP3A43Q9HB55 503 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 PCDH9Q9HC56 1237 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 C12orf4Q9NQ89 552 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 ERAP1Q9NZ08 941 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 DNPEPQ9ULA0 475 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 SHOC2Q9UQ13 582 aa9.5□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 TMEM120BA0PK00 339 aa9.49□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 C2orf72A6NCS6 295 aa9.49□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 CCT8L1PA6NM43 557 aa9.49□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 MAGEB2O15479 319 aa9.49□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 DDHD2O94830 711 aa9.49□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 GSTA1P08263 222 aa9.49□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 TXNP10599 105 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 KRT3P12035 628 aa9.49□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 RPS2P15880 293 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 EPB42P16452 691 aa9.49□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 ARSEP51690 589 aa9.49□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 SEC13P55735 322 aa9.49□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 KDSRQ06136 332 aa9.49□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 SPIDRQ14159 915 aa9.49□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 IL23RQ5VWK5 629 aa9.49□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 TDRPQ86YL5 185 aa9.49□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 HACE1Q8IYU2 909 aa9.49□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 LRRC34Q8IZ02 419 aa9.49□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 SHCBP1Q8NEM2 672 aa9.49□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 TFAP2BQ92481 460 aa9.49□□□□□ -0.89
USP16-206ENST00000485067 NSMCE3Q96MG7 304 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms