RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 ITGB1P05556 798 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 ALDH1B1P30837 517 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 HOXD12P35452 270 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 CCT4P50991 539 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 DRG2P55039 364 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 GPS1Q13098 491 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 CRHR2Q13324 411 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 NFYCQ13952 458 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 ERV3-1Q14264 604 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 CCNG2Q16589 344 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 GALNTL6Q49A17 601 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 UBXN11Q5T124 520 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 KRT77Q7Z794 578 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 CHD1LQ86WJ1 897 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 CFAP52Q8N1V2 620 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 ADAMTS15Q8TE58 950 aa6.21□□□□□ -1.42
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STRADBP1-201ENST00000478954 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 EPHX3Q9H6B9 360 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 ACAD9Q9H845 621 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 TMOD4Q9NZQ9 345 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 PI4KBQ9UBF8 816 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 LAMB2P55268 1798 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 SCN9AQ15858 1988 aa6.2□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa6.2□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.2□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 MATN2O00339 956 aa6.2□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
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STRADBP1-201ENST00000478954 CTSWP56202 376 aa6.2□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 KRT17Q04695 432 aa6.2□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
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STRADBP1-201ENST00000478954 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.2□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 TAF2Q6P1X5 1199 aa6.2□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC30A10Q6XR72 485 aa6.2□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.2□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.2□□□□□ -1.42
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STRADBP1-201ENST00000478954 NOD2Q9HC29 1040 aa6.2□□□□□ -1.42
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STRADBP1-201ENST00000478954 TBX20Q9UMR3 447 aa6.2□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 UBR2Q8IWV8 1755 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa6.19□□□□□ -1.42
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STRADBP1-201ENST00000478954 VWA3AA6NCI4 1184 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 YDJCA8MPS7 323 aa6.19□□□□□ -1.42
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STRADBP1-201ENST00000478954 FOSL2P15408 326 aa6.19□□□□□ -1.42
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STRADBP1-201ENST00000478954 ALDH1L2Q3SY69 923 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.19□□□□□ -1.42
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STRADBP1-201ENST00000478954 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa6.19□□□□□ -1.42
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STRADBP1-201ENST00000478954 MCRS1Q96EZ8 462 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 BORCS6Q96GS4 357 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 ASB2Q96Q27 587 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 HSF4Q9ULV5 492 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 SHOC2Q9UQ13 582 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 CDYLQ9Y232 598 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 NR2E1Q9Y466 385 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 FLT4P35916 1363 aa6.18□□□□□ -1.42
STRADBP1-201ENST00000478954 KIF24Q5T7B8 1368 aa6.18□□□□□ -1.42
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