RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470268.1

SF3B1-208, Transcript of splicing factor 3b subunit 1, human

TSL 2

Gene SF3B1, Length 2,003 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SF3B1-208	ENST00000470268	PTP4A2	Q12974	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	GPM6B	Q13491	265 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	MAP7	Q14244	749 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	NAA35	Q5VZE5	725 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	PMF1	Q6P1K2	205 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	CPXM1	Q96SM3	734 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	LHX5	Q9H2C1	402 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	DEF6	Q9H4E7	631 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	TLR9	Q9NR96	1032 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268		F8VP50	259 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268		H7C4K7	107 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	PER2	O15055	1255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	MED7	O43513	233 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	TGM5	O43548	720 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	UQCRH	P07919	91 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	SPATA31D3	P0C874	917 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	GZMA	P12544	262 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	ATF2	P15336	505 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	RGS7	P49802	495 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	MAP3K7CL	P57077	242 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	UBE3A	Q05086	875 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	DUSP4	Q13115	394 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	PDCL	Q13371	301 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	STIL	Q15468	1287 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	LILRA6	Q6PI73	481 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	PIGZ	Q86VD9	579 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	GPR65	Q8IYL9	337 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	SAMD11	Q96NU1	681 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	MED10	Q9BTT4	135 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	DUSP16	Q9BY84	665 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268	GBF1	Q92538	1859 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SF3B1-208	ENST00000470268		A0A1W2PPC1	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SF3B1-208	ENST00000470268	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SF3B1-208	ENST00000470268		E5RJQ4	531 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SF3B1-208	ENST00000470268	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SF3B1-208	ENST00000470268	GJB6	O95452	261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SF3B1-208	ENST00000470268	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SF3B1-208	ENST00000470268	ERBB2	P04626	1255 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SF3B1-208	ENST00000470268	FAM200B	P0CF97	657 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SF3B1-208	ENST00000470268	ATF6	P18850	670 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SF3B1-208	ENST00000470268	RAB6A	P20340	208 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SF3B1-208	ENST00000470268	ABCB4	P21439	1286 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SF3B1-208	ENST00000470268	MMP8	P22894	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SF3B1-208	ENST00000470268	ANXA13	P27216	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SF3B1-208	ENST00000470268	CA8	P35219	290 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SF3B1-208	ENST00000470268	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SF3B1-208	ENST00000470268	MAGEA1	P43355	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SF3B1-208	ENST00000470268	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SF3B1-208	ENST00000470268	PGF	P49763	221 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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