RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 STT3AP46977 705 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 OMPP47874 163 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGDIBP52566 201 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 BTN1A1Q13410 526 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 SLC45A4Q5BKX6 768 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 C12orf60Q5U649 245 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 RD3Q7Z3Z2 195 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 SLC38A6Q8IZM9 456 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 OR4C6Q8NH72 309 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 DPF2Q92785 391 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TBC1D20Q96BZ9 403 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 KATNAL1Q9BW62 490 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC106Q9BWC9 280 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM9Q9C026 710 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TRABDQ9H4I3 376 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 GNG8Q9UK08 70 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PALD1Q9ULE6 856 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 CHKBQ9Y259 395 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 DERAQ9Y315 318 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 HSPB11Q9Y547 144 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 F5H423 210 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 MICAL2O94851 1124 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 FGGP02679 453 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 C9P02748 559 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 IL6P05231 212 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 CSF1RP07333 972 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 RPS2P15880 293 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 GALK2Q01415 458 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 BNIP3Q12983 259 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 DSG2Q14126 1118 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 STAT4Q14765 748 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TEAD4Q15561 434 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 LRIT3Q3SXY7 679 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 GNASQ5JWF2 1037 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 STRIP1Q5VSL9 837 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 HGSNATQ68CP4 663 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 SLFN12LQ6IEE8 588 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PAOXQ6QHF9 649 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 CFAP77Q6ZQR2 320 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 FAM160B2Q86V87 743 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ATPAF2Q8N5M1 289 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF565Q8N9K5 539 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 SLC4A11Q8NBS3 891 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ESR2Q92731 530 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 SUCLG2Q96I99 432 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ELMO2Q96JJ3 720 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 HIPK3Q9H422 1215 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 SMYD2Q9NRG4 433 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 A6NCN8 305 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ITM2AO43736 263 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 BBOX1O75936 387 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 HMOX1P09601 288 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 CYP2D6P10635 497 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 MMP8P22894 467 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 BTN3A2P78410 334 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 GLO1Q04760 184 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 NME3Q13232 169 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 DNASE1L3Q13609 305 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TAF5Q15542 800 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 FAM26DQ5JW98 314 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TMC3Q7Z5M5 1100 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 CLYBLQ8N0X4 340 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 FAR1Q8WVX9 515 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TEKT5Q96M29 485 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 SLC22A4Q9H015 551 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 SLC6A17Q9H1V8 727 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TIMM22Q9Y584 194 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 H0Y858 1186 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PALMO75781 387 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TGM6O95932 706 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ITGB1P05556 798 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 GLAP06280 429 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 FABP1P07148 127 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 JUPP14923 745 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 HPGDP15428 266 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 NFKB1P19838 968 aa5.71□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms