RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC10A6Q3KNW5 377 aa18.77■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 FKBP1CQ5VVH2 108 aa18.77■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 LAYNQ6UX15 382 aa18.77■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 STRA8Q7Z7C7 330 aa18.77■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ICA1LQ8NDH6 482 aa18.77■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 CATSPER2Q96P56 530 aa18.77■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 CDH22Q9UJ99 828 aa18.77■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC39A10Q9ULF5 831 aa18.77■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 RNF103O00237 685 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 MAGEC1O60732 1142 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 RNF111Q6ZNA4 994 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP18.76■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 42.5
PTPRJ-202ENST00000440289 OR52B2Q96RD2 323 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 CENPKQ9BS16 269 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 COG4Q9H9E3 785 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 NFKBIEO00221 500 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 INSRRP14616 1297 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ARSAP15289 507 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 MAVSQ7Z434 540 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 SPATA24Q86W54 205 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 SNX32Q86XE0 403 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 FNIP1Q8TF40 1166 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 HTR3CQ8WXA8 447 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 POMPQ9Y244 141 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 SDR42E2A6NKP2 422 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 MFSD11O43934 449 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 VAV1P15498 845 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF460Q14592 562 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 SOWAHAQ2M3V2 549 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF618Q5T7W0 954 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 METTL7BQ6UX53 244 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 OMDQ99983 421 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 GRIP2Q9C0E4 1043 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 KLHL4Q9C0H6 718 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ETAA1Q9NY74 926 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 EFR3BQ9Y2G0 817 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ASB3Q9Y575 518 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 CPA3P15088 417 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ABCD1P33897 745 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 CRHR1P34998 444 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 NRF1Q16656 503 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF534Q76KX8 674 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 MFSD3Q96ES6 412 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 CDRT15Q96T59 188 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 TBCBQ99426 244 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 SNTG2Q9NY99 539 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 DTLQ9NZJ0 730 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 PDP2Q9P2J9 529 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 KIF3CO14782 793 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 PLIN3O60664 434 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 MPSTP25325 297 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 RAP1GDS1P52306 607 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 PCLAFQ15004 111 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 CNGA3Q16281 694 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 FETUBQ9UGM5 382 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 EMCNQ9ULC0 261 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ZBTB14O43829 449 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 CSPG5O95196 566 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 LTFP02788 710 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 SULT1E1P49888 294 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 CCNIQ14094 377 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ACAP1Q15027 740 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 LIN52Q52LA3 116 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 MBLAC2Q68D91 279 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ACVR1CQ8NER5 493 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 MAPK15Q8TD08 544 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 PPP2R3CQ969Q6 453 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 CSPG4P5Q96PW8 444 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 TASP1Q9H6P5 420 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 TK2O00142 265 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 CLDN5O00501 218 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 B4GALT4O60513 344 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 VCLP18206 1134 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 LMO2P25791 158 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 PDK3Q15120 406 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ILDR2Q71H61 639 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 MFN1Q8IWA4 741 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 DTNAQ9Y4J8 743 aa18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms