RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa20.3■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 COX16Q9P0S2 106 aa20.3■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 TJP2Q9UDY2 1190 aa20.3■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa20.3■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 KCNJ18B7U540 433 aa20.29■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 DLDP09622 509 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 KRT9P35527 623 aa20.29■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 RPS24P62847 133 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
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NPAS1-201ENST00000439365 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
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NPAS1-201ENST00000439365 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
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NPAS1-201ENST00000439365 SHC3Q92529 594 aa20.29■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 RNF34Q969K3 372 aa20.29■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa20.29■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
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NPAS1-201ENST00000439365 FAM204AQ9H8W3 233 aa20.29■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 SUSD2Q9UGT4 822 aa20.29■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 DNAJC12Q9UKB3 198 aa20.29■□□□□ 0.84
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NPAS1-201ENST00000439365 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 SYPP08247 313 aa20.28■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 ST8SIA6P61647 398 aa20.28■□□□□ 0.84
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NPAS1-201ENST00000439365 MS4A13Q5J8X5 152 aa20.28■□□□□ 0.84
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NPAS1-201ENST00000439365 CHSY1Q86X52 802 aa20.28■□□□□ 0.84
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NPAS1-201ENST00000439365 SLC39A13Q96H72 371 aa20.28■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 NUP58Q9BVL2 599 aa20.28■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 LHX5Q9H2C1 402 aa20.28■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM245Q9H330 911 aa20.28■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 NDST4Q9H3R1 872 aa20.28■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 SLC32A1Q9H598 525 aa20.28■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa20.28■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 CEP83Q9Y592 693 aa20.28■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 ARHGAP33O14559 1287 aa20.27■□□□□ 0.84
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NPAS1-201ENST00000439365 GRAP2O75791 330 aa20.27■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 CDK17Q00537 523 aa20.27■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
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NPAS1-201ENST00000439365 CPXM1Q96SM3 734 aa20.27■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.27■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 PDCL3Q9H2J4 239 aa20.27■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 CAPN10Q9HC96 672 aa20.27■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.27■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 SUN2Q9UH99 717 aa20.27■□□□□ 0.84
NPAS1-201ENST00000439365 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
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NPAS1-201ENST00000439365 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
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NPAS1-201ENST00000439365 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
NPAS1-201ENST00000439365 MOCS3O95396 460 aa20.27■□□□□ 0.83
NPAS1-201ENST00000439365 DNTTP04053 509 aa20.27■□□□□ 0.83
NPAS1-201ENST00000439365 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
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NPAS1-201ENST00000439365 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa20.27■□□□□ 0.83
NPAS1-201ENST00000439365 SLC47A2Q86VL8 602 aa20.27■□□□□ 0.83
NPAS1-201ENST00000439365 DEFB106AQ8N104 65 aa20.27■□□□□ 0.83
NPAS1-201ENST00000439365 MINDY1Q8N5J2 469 aa20.27■□□□□ 0.83
NPAS1-201ENST00000439365 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa20.27■□□□□ 0.83
NPAS1-201ENST00000439365 CADM4Q8NFZ8 388 aa20.27■□□□□ 0.83
NPAS1-201ENST00000439365 OR2I1PQ8NGU4 316 aa20.27■□□□□ 0.83
NPAS1-201ENST00000439365 SNX19Q92543 992 aa20.27■□□□□ 0.83
NPAS1-201ENST00000439365 SIX2Q9NPC8 291 aa20.27■□□□□ 0.83
NPAS1-201ENST00000439365 DDIT4Q9NX09 232 aa20.27■□□□□ 0.83
NPAS1-201ENST00000439365 PCDHGC3Q9UN70 934 aa20.27■□□□□ 0.83
NPAS1-201ENST00000439365 F5H5T6 163 aa20.26■□□□□ 0.83
NPAS1-201ENST00000439365 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
NPAS1-201ENST00000439365 PMLP29590 882 aa20.26■□□□□ 0.83
NPAS1-201ENST00000439365 CSKP41240 450 aa20.26■□□□□ 0.83
NPAS1-201ENST00000439365 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
NPAS1-201ENST00000439365 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
NPAS1-201ENST00000439365 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
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