RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 APPL2Q8NEU8 664 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR6B3Q8NGW1 331 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 JOSD2Q8TAC2 188 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPATA18Q8TC71 538 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAGEB18Q96M61 343 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM121Q9BTD3 319 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRIM62Q9BVG3 475 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 CWH43Q9H720 699 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 PADI3Q9ULW8 664 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 STAP1Q9ULZ2 295 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 FANCMQ8IYD8 2048 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARHGEF37A1IGU5 675 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRBA1A5PL33 1030 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 CFAP73A6NFT4 308 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 C2CD4BA6NLJ0 364 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 E5RJQ4 531 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 H7C0C1 242 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 ALOX15BO15296 676 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 TM9SF1O15321 606 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 HUS1O60921 280 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 EOMESO95936 686 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 GSTA2P09210 222 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM163BP0C2L3 166 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 DRD4P21917 467 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARL4AP40617 200 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATP5OP48047 213 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 IFNAR2P48551 515 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 NR2C2P49116 596 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 LIG3P49916 1009 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 AIF1P55008 147 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDH8P55286 799 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 BCAR1P56945 870 aa6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC6A3Q01959 620 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 XRCC4Q13426 336 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDO1Q16878 200 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIZQ2M2Z5 673 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC38Q502W7 563 aa6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1P1-201ENST00000437111 MARCH8Q5T0T0 291 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 EXOC3L1Q86VI1 746 aa6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1P1-201ENST00000437111 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 EMC1Q8N766 993 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANKRD42Q8N9B4 389 aa6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1P1-201ENST00000437111 FBF1Q8TES7 1133 aa6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1P1-201ENST00000437111 COL26A1Q96A83 441 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRC39Q96DD0 335 aa6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1P1-201ENST00000437111 HSFY1Q96LI6 401 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 C9orf72Q96LT7 481 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 TWNKQ96RR1 684 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 CYTH2Q99418 400 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 RTKNQ9BST9 563 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 SDCBP2Q9H190 292 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 KCNK12Q9HB15 430 aa6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1P1-201ENST00000437111 SNTG2Q9NY99 539 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1P1-201ENST00000437111 HMGXB4Q9UGU5 601 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 PCSK1NQ9UHG2 260 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 GINS2Q9Y248 185 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 SQORQ9Y6N5 450 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1P1-201ENST00000437111 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 KPNA7A9QM74 516 aa6.51□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 HACD1B0YJ81 288 aa6.51□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.51□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 E7ESA3 106 aa6.51□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.51□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 MGEA5O60502 916 aa6.51□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 RECQL4O94761 1208 aa6.51□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 DCNP07585 359 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 INHBAP08476 426 aa6.51□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 KCNE1P15382 129 aa6.51□□□□□ -1.37
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