RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

BASIC

Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 TFAP2BQ92481 460 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 FUOMA2VDF0 154 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 CCNE2O96020 404 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF12P17014 697 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 ME2P23368 584 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 HMOX2P30519 316 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 SFNP31947 248 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 SERPINB5P36952 375 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 HALP42357 657 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 SLC15A3Q8IY34 581 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 BORCS5Q969J3 196 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 ISOC1Q96CN7 298 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 BRD8Q9H0E9 1235 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 CAAP1Q9H8G2 361 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 USP18Q9UMW8 372 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 COQ6Q9Y2Z9 468 aa22.42■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 H0YCG3 227 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 FBP2O00757 339 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 ACOT8O14734 319 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF24P17028 368 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 PROZP22891 400 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 EMC1Q8N766 993 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 MAPK15Q8TD08 544 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 EME1Q96AY2 570 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 TJP2Q9UDY2 1190 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 TRIM64CA6NLI5 447 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 ATG7O95352 703 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 ASS1P00966 412 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 PPM1LQ5SGD2 360 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF781Q8N8C0 355 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 EBF1Q9UH73 591 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 TMED5Q9Y3A6 229 aa22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 WDR81Q562E7 1941 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 HTR3EA5X5Y0 456 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 SLC22A2O15244 555 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 ALDH1A2O94788 518 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 RBL1P28749 1068 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 PKNOX1P55347 436 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 NIPAL4Q0D2K0 466 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 IKBKEQ14164 716 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 DENND1BQ6P3S1 775 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 ITPKCQ96DU7 683 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 SGF29Q96ES7 293 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 CEP170P1Q96L14 293 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 OR52B2Q96RD2 323 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 WRNIP1Q96S55 665 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 SLC4A5Q9BY07 1137 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 TCF7L2Q9NQB0 619 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 CISHQ9NSE2 258 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 TMEM216Q9P0N5 145 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 TMX2Q9Y320 296 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 NRF1Q16656 503 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF394Q53GI3 561 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 STEAP4Q687X5 459 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 DCDC5Q6ZRR9 648 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 GPR141Q7Z602 305 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 ACER1Q8TDN7 264 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 PEBP4Q96S96 227 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 COQ10BQ9H8M1 238 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 RMI1Q9H9A7 625 aa22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 TFPTP0C1Z6 253 aa22.39■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 TPSB2P20231 275 aa22.39■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 MX2P20592 715 aa22.39■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 ADORA2AP29274 412 aa22.39■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 SLC5A3P53794 718 aa22.39■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 CDH6P55285 790 aa22.39■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 TPSAB1Q15661 275 aa22.39■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 ZBED5Q49AG3 693 aa22.39■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.39■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.39■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 HIPK3Q9H422 1215 aa22.39■■□□□ 1.18
CLDN5-201ENST00000403084 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms