RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 CCNYQ8ND76 341 aa23.73■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa23.73■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 KCNV2Q8TDN2 545 aa23.73■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 NR2E3Q9Y5X4 410 aa23.73■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 HAS3O00219 553 aa23.73■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 PSMB4P28070 264 aa23.73■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 AQP5P55064 265 aa23.73■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 SPANXN3Q5MJ09 141 aa23.73■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF567Q8N184 647 aa23.73■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 TEX9Q8N6V9 391 aa23.73■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 NTAN1Q96AB6 310 aa23.73■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 PRDM12Q9H4Q4 367 aa23.73■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 DCLK1O15075 740 aa23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 CREB3O43889 395 aa23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 POLBP06746 335 aa23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 RFWD3Q6PCD5 774 aa23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 PAQR9Q6ZVX9 377 aa23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 MED10Q9BTT4 135 aa23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 SEPT10Q9P0V9 454 aa23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 SORCS3Q9UPU3 1222 aa23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 GABRDO14764 452 aa23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 GCKP35557 465 aa23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 GARSP41250 739 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 HIC1Q14526 733 aa23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 NAA25Q14CX7 972 aa23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 CLEC20AQ6ZU45 233 aa23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 TLK2Q86UE8 772 aa23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 TMPRSS6Q8IU80 811 aa23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 PGBD4Q96DM1 585 aa23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 SPON1Q9HCB6 807 aa23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 STOML1Q9UBI4 398 aa23.72■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 CLDN5O00501 218 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 TPP1O14773 563 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM200BP0CF97 657 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 HCAR3P49019 387 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 CRADDP78560 199 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 SCAPQ12770 1279 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 MBLAC2Q68D91 279 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 UNC5BQ8IZJ1 945 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 BRD8Q9H0E9 1235 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 SYBUQ9NX95 663 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 ARMCX1Q9P291 453 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 TAGLN3Q9UI15 199 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 F5H423 210 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 NCAM2O15394 837 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 TREHO43280 583 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 MAGEC1O60732 1142 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 ADRA1BP35368 520 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 TKTL1P51854 596 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 NME3Q13232 169 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 DSTYKQ6XUX3 929 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 RASSF3Q86WH2 238 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 ARRDC4Q8NCT1 418 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 PIGVQ9NUD9 493 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 TXNDC16Q9P2K2 825 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 ADAM28Q9UKQ2 775 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 EMCNQ9ULC0 261 aa23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-202ENST00000399409 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 C9IYK1 514 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 PLIN3O60664 434 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 BEST1O76090 585 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 GSRP00390 522 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 SERPINA6P08185 405 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 ITGA2BP08514 1039 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 NDUFV1P49821 464 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 GJA9P57773 515 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 PDE1BQ01064 536 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 MDH1BQ5I0G3 518 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 GRTP1Q5TC63 336 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 SYPL2Q5VXT5 272 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 WSCD1Q658N2 575 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 PID1Q7Z2X4 250 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 CPNE1Q99829 537 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM96AQ9H5X1 160 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 COX16Q9P0S2 106 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 ZFATQ9P243 1243 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 PGM1P36871 562 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 GP5P40197 560 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 CPT1AP50416 773 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 RAP1GDS1P52306 607 aa23.7■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms