RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 CITED4Q96RK1 184 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 ISCA1Q9BUE6 129 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 PACSIN1Q9BY11 444 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 DCLK3Q9C098 648 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 KIF17Q9P2E2 1029 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 VPS28Q9UK41 221 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 EP400Q96L91 3159 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 SALL3Q9BXA9 1300 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 PEX11AO75192 247 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 CCNKO75909 580 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 NFICP08651 508 aa7.01□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 THEGLP0DJG4 465 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 TCP1P17987 556 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 GRK3P35626 688 aa7.01□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 SLC15A1P46059 708 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 ADKP55263 362 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 NCALDP61601 193 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP11AP98196 1134 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 SCRN3Q0VDG4 424 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 ZCWPW2Q504Y3 356 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 SULT1C3Q6IMI6 304 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 ERO1BQ86YB8 467 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP7.01□□□□□ -1.295e-6■■■■■ 81.8
RABGEF1-202ENST00000380828 MPP5Q8N3R9 675 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 NCOA7Q8NI08 942 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 METTL6Q8TCB7 284 aa7.01□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 GGT7Q9UJ14 662 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHGC3Q9UN70 934 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 GPR34Q9UPC5 381 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 PSMD9O00233 223 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 EXOC3O60645 756 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 RGS2P41220 211 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 RABIFP47224 123 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 SRP54P61011 504 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 UBE3AQ05086 875 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 EFR3AQ14156 821 aa7□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 ADGRF1Q5T601 910 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 JADE1Q6IE81 842 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 OGFOD2Q6N063 350 aa7□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 WDR93Q6P2C0 686 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA2013Q8IYS2 634 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 SPATA4Q8NEY3 305 aa7□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 WFDC12Q8WWY7 111 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 TCF25Q9BQ70 676 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 CNPY3Q9BT09 278 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 INTS13Q9NVM9 706 aa7□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 INVSQ9Y283 1065 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 RAD54BQ9Y620 910 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 TTC26A0AVF1 554 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM120BA0PK00 339 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 PFKFB2O60825 505 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 GJB3O75712 270 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 GPX5O75715 221 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 CHRNA5P30532 468 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 SELENBP1Q13228 472 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 PRKG2Q13237 762 aa7□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 ASPGQ86U10 573 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 ART5Q96L15 291 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 GAB2Q9UQC2 676 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 GMNCA6NCL1 334 aa7□□□□□ -1.29
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