RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368223.3

NES-201, Transcript of nestin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NES, Length 5,558 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NES-201ENST00000368223 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
NES-201ENST00000368223 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.14■□□□□ 0.82
NES-201ENST00000368223 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 TGM3Q08188 693 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 ZNF844Q08AG5 666 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 GRIK3Q13003 919 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 OPTNQ96CV9 577 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 EHD4Q9H223 541 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 POMKQ9H5K3 350 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 ADAM30Q9UKF2 790 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 SESN1Q9Y6P5 492 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 HS6ST1O60243 411 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 CDH8P55286 799 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 NTRK3Q16288 839 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 INAQ16352 499 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 DNPEPQ9ULA0 475 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 CPS1P31327 1500 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 TRIM13O60858 407 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 COX10Q12887 443 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 RD3Q7Z3Z2 195 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 MYLK2Q9H1R3 596 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 SERHL2Q9H4I8 314 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 SERHLQ9NQF3 203 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 THAP1Q9NVV9 213 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 LIMD1Q9UGP4 676 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 KLHL3Q9UH77 587 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 GAKO14976 1311 aa20.14■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 MRASO14807 208 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 ALDH2P05091 517 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 CLK2P49760 499 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 FAAP100Q0VG06 881 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 ATP1A4Q13733 1029 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 NEDD8Q15843 81 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 EID3Q8N140 333 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 ATP6V1HQ9UI12 483 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 TBKBP1A7MCY6 615 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 KCNK1O00180 336 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 MYBPC2Q14324 1141 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 VTI1BQ9UEU0 232 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 DLC1Q96QB1 1528 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 SH3BGRLO75368 114 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 PSMD7P51665 324 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 OSCP1Q8WVF1 389 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 RNF145Q96MT1 663 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 PNMA5Q96PV4 448 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 STARD7Q9NQZ5 370 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 KLHL28Q9NXS3 571 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 NFICP08651 508 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 CCDC130P13994 396 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 TNNI3P19429 210 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 CRABP2P29373 138 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 MAPK9P45984 424 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 TMEM159Q96B96 161 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 RIBC2Q9H4K1 309 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 NMRAL1Q9HBL8 299 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 CHD1O14646 1710 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 FAM86B1E9PN63 330 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 GHRP10912 638 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 NOS3P29474 1203 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 RENBPP51606 427 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 PLK1P53350 603 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 PRMT9Q6P2P2 845 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 DEFB106AQ8N104 65 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 OR6Y1Q8NGX8 325 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 ASZ1Q8WWH4 475 aa20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa20.12■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 TBC1D12O60347 775 aa20.12■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 ACADMP11310 421 aa20.12■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 SLC34A1Q06495 639 aa20.12■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 WASHC2DQ5SRD0 308 aa20.12■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 CCDC149Q6ZUS6 474 aa20.12■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 ERLEC1Q96DZ1 483 aa20.12■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 DAPK2Q9UIK4 370 aa20.12■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 LACTBL1A8MY62 500 aa20.12■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 CASP12Q6UXS9 341 aa20.12■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 SNX32Q86XE0 403 aa20.12■□□□□ 0.81
NES-201ENST00000368223 CDK20Q8IZL9 346 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms