RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SEC23BQ15437 767 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 LEKR1Q6ZMV7 388 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC8DQ7L1W4 858 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ADGRF2Q8IZF7 708 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 EXOC6Q8TAG9 804 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 FBXO30Q8TB52 745 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SNX33Q8WV41 574 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SHISA4Q96DD7 197 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM5Q9C035 493 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 GPR88Q9GZN0 384 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 MMRN2Q9H8L6 949 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 RLIMQ9NVW2 624 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SQORQ9Y6N5 450 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 GOLGA6L10A6NI86 522 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 FADS2P1A8MWK0 482 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SMPD2O60906 423 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM16O95361 564 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 KCNA5P22460 613 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 PTAFRP25105 342 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ADH6P28332 368 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SLC6A4P31645 630 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 MSH2P43246 934 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 LMAN1P49257 510 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ANTXR2P58335 489 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 SARNPP82979 210 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 GBE1Q04446 702 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 GPS2Q13227 327 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC142Q17RM4 750 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 TIGD6Q17RP2 521 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF750Q32MQ0 723 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 CYP4A22Q5TCH4 519 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 NCEH1Q6PIU2 408 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 RNF111Q6ZNA4 994 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 MIPOL1Q8TD10 442 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC34Q96HJ3 373 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 KCNJ15Q99712 375 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 OPA3Q9H6K4 179 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 MCM9Q9NXL9 1143 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 CYP39A1Q9NYL5 469 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 HCN3Q9P1Z3 774 aa2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
CCSAP-202ENST00000366686 PTPRFP10586 1907 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF541Q9H0D2 1346 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 TCRBV5S2A0A599 114 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 OR2A25A4D2G3 310 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 E7EVH7 732 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 MTSS1O43312 755 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ZBTB14O43829 449 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 RTN2O75298 545 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SLC43A1O75387 559 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 PFKLP17858 780 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 IL15P40933 162 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 NUCB2P80303 420 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ANKDD1AQ495B1 522 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SPDYAQ5MJ70 313 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 AKNAD1Q5T1N1 836 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 DEPDC1Q5TB30 811 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 MFSD4BQ5TF39 518 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 IL17RCQ8NAC3 791 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SPATA20Q8TB22 786 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 FNBP1Q96RU3 617 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 NUDT22Q9BRQ3 303 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ADPRHL2Q9NX46 363 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 LMCD1Q9NZU5 365 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 VPS18Q9P253 973 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ABI3Q9P2A4 366 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 FTSJ1Q9UET6 329 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHA6Q9UN73 950 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 AKAP11Q9UKA4 1901 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 LAMA1P25391 3075 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CHMP2AO43633 222 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 METTL18O95568 372 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 FAHP16930 419 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 DESP17661 470 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 GABRB1P18505 474 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CCNA2P20248 432 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ADRA1BP35368 520 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms