RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311659.4

UBQLN3-201, Transcript of ubiquilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN3, Length 2,407 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN3-201ENST00000311659 ZMPSTE24O75844 475 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 KRT34O76011 436 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 MAP3K6O95382 1288 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 FAM200BP0CF97 657 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 BCAR1P56945 870 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 KLF10Q13118 480 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 ORC1Q13415 861 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 SURF1Q15526 300 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 BORAQ6PGQ7 559 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 C4orf22Q6V702 233 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 PACS1Q6VY07 963 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 ZFP28Q8NHY6 868 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 RXFP2Q8WXD0 754 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 CDHR1Q96JP9 859 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 ELOVL4Q9GZR5 314 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 PCDH18Q9HCL0 1135 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF302Q9NR11 478 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 MTMR10Q9NXD2 777 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 DCDC2Q9UHG0 476 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 RIMS3Q9UJD0 308 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 GPR25O00155 361 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 DCXO43602 365 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 STRNO43815 780 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 PRPSAP2O60256 369 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 CDK4P11802 303 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 CD1EP15812 388 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 CDH8P55286 799 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 SEMA5AQ13591 1074 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 ADGRE1Q14246 886 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 INSCQ1MX18 579 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 MYLK3Q32MK0 819 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 EPGNQ6UW88 154 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 MOB2Q70IA6 237 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 REPS2Q8NFH8 660 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 PPP4R1Q8TF05 950 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 TMEM216Q9P0N5 145 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 BTBD7Q9P203 1132 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 SIX4Q9UIU6 781 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 DMTF1Q9Y222 760 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa8.72□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 C19orf81C9J6K1 198 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 B4GALT4O60513 344 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 COQ9O75208 318 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 CILPO75339 1184 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 TNFAIP8O95379 198 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC166P0CW27 439 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 IMPDH2P12268 514 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC130P13994 396 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 PDGFRAP16234 1089 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 GLDCP23378 1020 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 PCSK6P29122 969 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 EMP3P54852 163 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 HMGCS2P54868 508 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 GK3PQ14409 553 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 KRT81Q14533 505 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 CA9Q16790 459 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC14Q49A88 953 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 SH2D4BQ5SQS7 431 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 KLC3Q6P597 504 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 MAP7D3Q8IWC1 876 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 MAPK15Q8TD08 544 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 LZICQ8WZA0 190 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 ATG4CQ96DT6 458 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF670Q9BS34 389 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 SLC2A11Q9BYW1 496 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 COG4Q9H9E3 785 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 PSAT1Q9Y617 370 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 AP4B1Q9Y6B7 739 aa8.71□□□□□ -1.01
UBQLN3-201ENST00000311659 A0A0J9YVX5 310 aa8.71□□□□□ -1.02
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF487B1APH4 448 aa8.71□□□□□ -1.02
UBQLN3-201ENST00000311659 M0QYV0 167 aa8.71□□□□□ -1.02
UBQLN3-201ENST00000311659 DPYSL4O14531 572 aa8.71□□□□□ -1.02
UBQLN3-201ENST00000311659 RALBP11234 206 aa8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms