RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 BICDL2A1A5D9 508 aa20.38■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 BMP6P22004 513 aa20.38■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 NADSYN1Q6IA69 706 aa20.38■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 C1orf216Q8TAB5 229 aa20.38■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 GAREM1Q9H706 876 aa20.38■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 FBRSQ9HAH7 460 aa20.38■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.38■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 CER1O95813 267 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 FYNP06241 537 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 C7P10643 843 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 MATKP42679 507 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 RPS14P62263 151 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 BNC1Q01954 994 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 KCNH2Q12809 1159 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 IL27RAQ6UWB1 636 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 MFN1Q8IWA4 741 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 TRIM59Q8IWR1 403 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 SCUBE3Q8IX30 993 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 KREMEN1Q96MU8 473 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 SERPINB11Q96P15 392 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 ST7Q9NRC1 585 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 SUN2Q9UH99 717 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.37■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 A0A1B0GVT2 93 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 BIN1O00499 593 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 DNTTP04053 509 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 FTH1P19P0C7X4 201 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 GPD2P43304 727 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 STX17P56962 302 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 ZBTB16Q05516 673 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 MORC3Q14149 939 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 HLA-BQ31612 363 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 FIBINQ8TAL6 211 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 LMLNQ96KR4 655 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 BTBD1Q9H0C5 482 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 MTG2Q9H4K7 406 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 TM7SF3Q9NS93 570 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 TLR6Q9Y2C9 796 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa20.36■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 AKAP13Q12802 2813 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 FAM221BA6H8Z2 402 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 SART1O43290 800 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 SEMA4FO95754 770 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 GNA14O95837 355 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 AFPP02771 609 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF883P0CG24 379 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 KRT5P13647 590 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 RPL34P49207 117 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 RPS24P62847 133 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 CARNMT1Q8N4J0 409 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 PNPLA1Q8N8W4 532 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 ADAM32Q8TC27 787 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 TTC17Q96AE7 1141 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 MYEOVQ96EZ4 313 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 MYO19Q96H55 970 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 SLC39A13Q96H72 371 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 CNTN6Q9UQ52 1028 aa20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 CBFA2T3O75081 653 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 CSKP41240 450 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 ACADSBP45954 432 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 MARSP56192 900 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 ST8SIA6P61647 398 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 NNTQ13423 1086 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 MS4A13Q5J8X5 152 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 SYPL2Q5VXT5 272 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 DENND1BQ6P3S1 775 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 BIRC7Q96CA5 298 aa20.34■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 NUMA1Q14980 2115 aa20.33■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 ZFHX4Q86UP3 3567 aa20.33■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 CAPN9O14815 690 aa20.33■□□□□ 0.85
CXCL3-201ENST00000296026 FSBPO95073 299 aa20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms