RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285896.10

CNOT8-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT8, Length 2,528 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8-201ENST00000285896 DDIT4Q9NX09 232 aa15.96■□□□□ 0.15
CNOT8-201ENST00000285896 MARCH5Q9NX47 278 aa15.96■□□□□ 0.15
CNOT8-201ENST00000285896 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 SLC5A9Q2M3M2 681 aa15.96■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 CTXN3Q4LDR2 81 aa15.96■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 EFHC2Q5JST6 749 aa15.96■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 TAOK1Q7L7X3 1001 aa15.96■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 ETNK1Q9HBU6 452 aa15.96■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 SCN5AQ14524 2016 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 PEX11AO75192 247 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 UNC5CO95185 931 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 PDHA1P08559 390 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 GM2AP17900 193 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 RPL22P35268 128 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 AIF1P55008 147 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 MPP2Q14168 576 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 ZNF280DQ6N043 979 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 MFSD5Q6N075 450 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 SCN4BQ8IWT1 228 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 TRIM62Q9BVG3 475 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 TBX21Q9UL17 535 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 SHOC2Q9UQ13 582 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 ASB3Q9Y575 518 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 TANC1Q9C0D5 1861 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 TNFRSF10BO14763 440 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 F9P00740 461 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 GALTP07902 379 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 FGFR3P22607 806 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 CALB2P22676 271 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 ADRA1BP35368 520 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 NR2C2P49116 596 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 MXRA7P84157 204 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 LONRF1Q17RB8 773 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 FUT10Q6P4F1 479 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 CEP128Q6ZU80 1094 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 PCGF5Q86SE9 256 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 CROCCP2Q86T23 111 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 LRRC43Q8N309 656 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 RNF139Q8WU17 664 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 NTAN1Q96AB6 310 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 B3GALT6Q96L58 329 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 TMEM175Q9BSA9 504 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 FBXW11Q9UKB1 542 aa15.95■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 OR6C75A6NL08 312 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 H3BRJ5 948 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 MAP3K6O95382 1288 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 TPBGLP0DKB5 382 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 AMPD1P23109 780 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 PBX3P40426 434 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 GBE1Q04446 702 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 GDAP1Q8TB36 358 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 CKAP2Q8WWK9 683 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 USP29Q9HBJ7 922 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 ARHGEF4Q9NR80 690 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 NLRC5Q86WI3 1866 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 PTPRDP23468 1912 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 CFAP69A5D8W1 941 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 ACSL3O95573 720 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 SCAPQ12770 1279 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 BEND5Q7L4P6 421 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 ANKRD42Q8N9B4 389 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 TMEM39AQ9NV64 488 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 ETNK2Q9NVF9 386 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa15.94■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 KCNN4O15554 427 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 CREB3O43889 395 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 TTC4O95801 387 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 ATP6V1C1P21283 382 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 NRLP54845 237 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 IKBKEQ14164 716 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 ARL13BQ3SXY8 428 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 RELL1Q8IUW5 271 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 PPIL6Q8IXY8 311 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 GALNT15Q8N3T1 639 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 PGLYRP2Q96PD5 576 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 RBL1P28749 1068 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 RNF43Q68DV7 783 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 CNKSR3Q6P9H4 555 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 TAC4Q86UU9 113 aa15.93■□□□□ 0.14
CNOT8-201ENST00000285896 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms