RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 TUBB3Q13509 450 aa28.78■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 MARCH8Q5T0T0 291 aa28.78■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 TMEM154Q6P9G4 183 aa28.78■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 PANX3Q96QZ0 392 aa28.78■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 LGMNQ99538 433 aa28.78■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 LPIN3Q9BQK8 851 aa28.78■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 SLC7A8Q9UHI5 535 aa28.78■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa28.78■■■□□ 2.2
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UBP1-201ENST00000283628 AP2B1P63010 937 aa28.78■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 IRX4P78413 519 aa28.78■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 GRIK3Q13003 919 aa28.78■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 CCL15Q16663 113 aa28.78■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 SLC25A52Q3SY17 297 aa28.78■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 PPP4R1Q8TF05 950 aa28.78■■■□□ 2.2
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UBP1-201ENST00000283628 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
UBP1-201ENST00000283628 ZNF778Q96MU6 729 aa28.78■■■□□ 2.2
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UBP1-201ENST00000283628 MYL4P12829 197 aa28.77■■■□□ 2.2
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UBP1-201ENST00000283628 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa28.77■■■□□ 2.2
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UBP1-201ENST00000283628 DNAJC28Q9NX36 388 aa28.76■■■□□ 2.19
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UBP1-201ENST00000283628 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
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UBP1-201ENST00000283628 ADAM28Q9UKQ2 775 aa28.74■■■□□ 2.19
UBP1-201ENST00000283628 PNPLA4P41247 253 aa28.73■■■□□ 2.19
UBP1-201ENST00000283628 HIC1Q14526 733 aa28.73■■■□□ 2.19
UBP1-201ENST00000283628 GRTP1Q5TC63 336 aa28.73■■■□□ 2.19
UBP1-201ENST00000283628 AAGABQ6PD74 315 aa28.73■■■□□ 2.19
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