RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 NMT2O60551 498 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 MYL4P12829 197 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 FGFR3P22607 806 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 CHKAP35790 457 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 NFYCQ13952 458 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 FUT11Q495W5 492 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 VAV3Q9UKW4 847 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 CAPN8A6NHC0 703 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 CYP2C8P10632 490 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 AKIRIN2Q53H80 203 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 C2CD6Q53TS8 623 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 KIAA0408Q6ZU52 694 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 CXorf21Q9HAI6 301 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 C5orf60A6NFR6 353 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 HBP1O60381 514 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TXNP10599 105 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ADRA1DP25100 572 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 NFIL3Q16649 462 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 DGKKQ5KSL6 1271 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 FAM182BQ5T319 152 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM26Q6ZUK4 368 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ASB12Q8WXK4 309 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PIGUQ9H490 435 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PRKAG3Q9UGI9 489 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 DPYSL4O14531 572 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 RASA1P20936 1047 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 CDH6P55285 790 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 BTBD8Q5XKL5 378 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 FITM2Q8N6M3 262 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 KIF12Q96FN5 646 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 NSMCE2Q96MF7 247 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TOR4AQ9NXH8 423 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 VTI1BQ9UEU0 232 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ATG7O95352 703 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 NME3Q13232 169 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 CRTC3Q6UUV7 619 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 C12orf56Q8IXR9 622 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 FAM47BQ8NA70 645 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TADA1Q96BN2 335 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 GIT1Q9Y2X7 761 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PP2D1A8MPX8 630 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TFECO14948 347 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 POLBP06746 335 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 YES1P07947 543 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 STAT5AP42229 794 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 NPTX2P47972 431 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 SRP54P61011 504 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 GARNL3Q5VVW2 1013 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PLET1Q6UQ28 207 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 CYP2R1Q6VVX0 501 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 RNF148Q8N7C7 305 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 HELQQ8TDG4 1101 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TCF12Q99081 682 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 SYT15Q9BQS2 421 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 HAT1O14929 419 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 INPP4BO15327 924 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 CYP26A1O43174 497 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TM7SF2O76062 418 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 CETPP11597 493 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 RPL26P61254 145 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 SCARF1Q14162 830 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 AGKQ53H12 422 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PHC2Q8IXK0 858 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 CERKQ8TCT0 537 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 SCFD2Q8WU76 684 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 WDR41Q9HAD4 459 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 SP110Q9HB58 689 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 HACL1Q9UJ83 578 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PIK3C2BO00750 1634 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TRIM64BA6NI03 449 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 SSNA1O43805 119 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TLR2O60603 784 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 NR3C2P08235 984 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms