RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272542.7

SLC20A1-201, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC20A1, Length 3,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-201ENST00000272542 RFPL1O75677 317 aa16.25■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 NR2C2P49116 596 aa16.25■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 BNIP1Q12981 228 aa16.25■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 RXFP1Q9HBX9 757 aa16.25■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 L3MBTL1Q9Y468 752 aa16.25■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 UNC80Q8N2C7 3258 aa16.25■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 HHLA1C9JL84 531 aa16.25■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 AOC2O75106 756 aa16.25■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 ZWINTO95229 277 aa16.25■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 GALNTL6Q49A17 601 aa16.25■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 MFSD14CQ5VZR4 134 aa16.25■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 MOCOSQ96EN8 888 aa16.25■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 LRRC37BQ96QE4 947 aa16.25■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 SPC25Q9HBM1 224 aa16.25■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF358Q9NW07 568 aa16.25■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 KANSL3Q9P2N6 904 aa16.25■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 HCSTQ9UBK5 93 aa16.25■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 H3BRJ5 948 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 LRIG2O94898 1065 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 XRCC4Q13426 336 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 BHLHA9Q7RTU4 235 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 TAC4Q86UU9 113 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 SCN4BQ8IWT1 228 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 PARP9Q8IXQ6 854 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 ARNTL2Q8WYA1 636 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 C20orf27Q9GZN8 174 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 NDFIP2Q9NV92 336 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC38A7Q9NVC3 462 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 SOAT2O75908 522 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 ETV4P43268 484 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 LHX1P48742 406 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 GPR15P49685 360 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 ZBTB17Q13105 803 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 CD300LGQ6UXG3 332 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 TTC7BQ86TV6 843 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC2A13Q96QE2 648 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 ADAMTS4O75173 837 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 IGHA2P01877 340 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC10A3P09131 477 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 SERPINB4P48594 390 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 DPYSQ14117 519 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 CERCAMQ5T4B2 595 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 OTOP3Q7RTS5 596 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 DNAAF3Q8N9W5 541 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 GSDMBQ8TAX9 411 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF778Q96MU6 729 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 Q9Y3F1 56 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 STARD13Q9Y3M8 1113 aa16.24■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 GPR182O15218 404 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 JCHAINP01591 159 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 PBX3P40426 434 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 ERFP50548 548 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 SEMA5AQ13591 1074 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 KCTD13Q8WZ19 329 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 APOPT1Q96IL0 206 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 AGAP2Q99490 1192 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 SHROOM3Q8TF72 1996 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 TMEM88BA6NKF7 163 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 DCLK1O15075 740 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 SEPT4O43236 478 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 KRT37O76014 449 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 MAGEA3P43357 314 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 NLRP9Q7RTR0 991 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 SPATA22Q8NHS9 363 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 C10orf82Q8WW14 230 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 ATP2A3Q93084 1043 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 MFSD3Q96ES6 412 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 TSSK1BQ9BXA7 367 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 ATXN3LQ9H3M9 355 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 ARMCX1Q9P291 453 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 FBXW11Q9UKB1 542 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 DFFAO00273 331 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 NDC80O14777 642 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 PTPN3P26045 913 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 NEK3P51956 506 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 ARPP19P56211 112 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 DDR2Q16832 855 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 CMC1Q7Z7K0 106 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 GORASP1Q9BQQ3 440 aa16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 SAT1P21673 171 aa16.22■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 PRKCHP24723 683 aa16.22■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 GRIK1P39086 918 aa16.22■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 MGAT3Q09327 533 aa16.22■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 OVOS1Q6IE37 1185 aa16.22■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 TTC9BQ8N6N2 239 aa16.22■□□□□ 0.19
SLC20A1-201ENST00000272542 SMARCD1Q96GM5 515 aa16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms