RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269886.7

SH3GL1-201, Transcript of SH3 domain containing GRB2 like 1, endophilin A2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3GL1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1-201ENST00000269886 CDK18Q07002 472 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 EFHC1Q5JVL4 640 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 ATG14Q6ZNE5 492 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 LMNTD2Q8IXW0 634 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 NME8Q8N427 588 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 RNF139Q8WU17 664 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 HSFY1Q96LI6 401 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 THTPAQ9BU02 230 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 RNF39Q9H2S5 420 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 A6NHS1 94 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 CLDN5O00501 218 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 SCUBE1Q8IWY4 988 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 APPL2Q8NEU8 664 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 PGBD4Q96DM1 585 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 PRDM12Q9H4Q4 367 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 ZFATQ9P243 1243 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 ADCY6O43306 1168 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 PLIN3O60664 434 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 NEBLO76041 1014 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 BEST1O76090 585 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 ITGA2BP08514 1039 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 ERVK-10P10266 1014 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 PGAM1P18669 254 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 MLH1P40692 756 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 SLC1A6P48664 564 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 NDUFV1P49821 464 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 PDE1BQ01064 536 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 HACE1Q8IYU2 909 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 ZNF567Q8N184 647 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 OR6J1Q8NGC5 347 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 OPHN1O60890 802 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 GLRA3O75311 464 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 PCLAFQ15004 111 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 MEI4A8MW99 385 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 PRKCGP05129 697 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 F7P08709 466 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 MXRA7P84157 204 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 NME3Q13232 169 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 TUBB3Q13509 450 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 ULK2Q8IYT8 1036 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 ACMSDQ8TDX5 336 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 TM7SF2O76062 418 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 STK10O94804 968 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 SNAPC2Q13487 334 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 DGKDQ16760 1214 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 STXBP5Q5T5C0 1151 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 SYPL2Q5VXT5 272 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 C10orf107Q8IVU9 208 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 PANX3Q96QZ0 392 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 SPON1Q9HCB6 807 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 M0QYT0 321 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 KCNK1O00180 336 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 GTF2A2P52657 109 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 CCNA1P78396 465 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 DUSP28Q4G0W2 176 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 OSTM1Q86WC4 334 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 RASSF3Q86WH2 238 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 CFAP61Q8NHU2 1237 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 TMEM40Q8WWA1 233 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 ZNF358Q9NW07 568 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 GDAP2Q9NXN4 497 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 TMEM216Q9P0N5 145 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 SLC7A8Q9UHI5 535 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1-201ENST00000269886 DPPA5A6NC42 116 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 CD4P01730 458 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 ARRB2P32121 409 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 GLUD2P49448 558 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 SHKBP1Q8TBC3 707 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 ATP2A3Q93084 1043 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 FAM136AQ96C01 138 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 DCDC2Q9UHG0 476 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 USP12O75317 370 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 LINGO3P0C6S8 592 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 DARSP14868 501 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 TUBP50607 506 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 PID1Q7Z2X4 250 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 UCMAQ8WVF2 138 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 AGAP3Q96P47 875 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 PNPOQ9NVS9 261 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 TAF6P49848 677 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 RABGGTBP53611 331 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 PDK1Q15118 436 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3GL1-201ENST00000269886 HFE2Q6ZVN8 426 aa24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms