RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 MAMLD1Q13495 774 aa23.08■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ZNF528Q3MIS6 628 aa23.08■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 BRMS1LQ5PSV4 323 aa23.08■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 C10orf76Q5T2E6 689 aa23.08■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 C14orf80Q86SX3 495 aa23.08■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 LGI2Q8N0V4 545 aa23.08■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 CFAP52Q8N1V2 620 aa23.08■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 TKTL2Q9H0I9 626 aa23.08■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa23.08■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 MFAP3LO75121 409 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ATG13O75143 517 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 RDXP35241 583 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 TIE1P35590 1138 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ZNF75DP51815 510 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 AUHQ13825 339 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 FBXL22Q6P050 247 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC24Q6P3W2 148 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 SYT13Q7L8C5 426 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 CHSY1Q86X52 802 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 FANCMQ8IYD8 2048 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ZNF683Q8IZ20 524 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 IGSF8Q969P0 613 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ABHD10Q9NUJ1 306 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 SNX10Q9Y5X0 201 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ADAM23O75077 832 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 GPD1P21695 349 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 SDC4P31431 198 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 GGCXP38435 758 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 IRAK1P51617 712 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 HDAC4P56524 1084 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 NHLH1Q02575 133 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 DMWDQ09019 674 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 C5orf22Q49AR2 442 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 TMC6Q7Z403 805 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 FAM131BQ86XD5 332 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ALLCQ8N6M5 410 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 FIBINQ8TAL6 211 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 MCEEQ96PE7 176 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 CHP1Q99653 195 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 TMEM51Q9NW97 253 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 STIM2Q9P246 746 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 SGK1O00141 431 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 CDO1Q16878 200 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 FSCBQ5H9T9 825 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 STRADAQ7RTN6 431 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ADIPOR2Q86V24 386 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 CCDC33Q8N5R6 958 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 CCDC26Q8TAB7 109 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 KCNV2Q8TDN2 545 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ACOX2Q99424 681 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 PHOX2BQ99453 314 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 MAGEB5Q9BZ81 275 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 TRIM7Q9C029 511 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 PARVAQ9NVD7 372 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 FAM86C1Q9NVL1 165 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 MMP17Q9ULZ9 603 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 USP34Q70CQ2 3546 aa23.04■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 TMEM191CA6NGB0 347 aa23.04■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 CCP110O43303 1012 aa23.04■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 HOXA6P31267 233 aa23.04■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 CD70P32970 193 aa23.04■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 MTA1Q13330 715 aa23.04■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 TMEM92Q6UXU6 159 aa23.04■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 FAM172AQ8WUF8 416 aa23.04■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 C1orf74Q96LT6 269 aa23.04■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 F5H5T6 163 aa23.03■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ADRA1BP35368 520 aa23.03■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa23.03■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 DMC1Q14565 340 aa23.03■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 NUDT18Q6ZVK8 323 aa23.03■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa23.03■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 TC2NQ8N9U0 490 aa23.03■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB44Q8NCP5 570 aa23.03■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 HAPLN3Q96S86 360 aa23.03■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 SIK2Q9H0K1 926 aa23.03■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa23.03■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ABCB8Q9NUT2 735 aa23.03■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ELOVL2Q9NXB9 296 aa23.03■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms