RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 YWHAQP27348 245 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MAPK9P45984 424 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CLCN3P51790 818 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 COX10Q12887 443 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SGCGQ13326 291 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TCEA2Q15560 299 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ZCWPW2Q504Y3 356 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CCDC149Q6ZUS6 474 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ULK2Q8IYT8 1036 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 REPS2Q8NFH8 660 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 FANCEQ9HB96 536 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 NEK6Q9HC98 313 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 KCND1Q9NSA2 647 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 COPG2Q9UBF2 871 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CROTQ9UKG9 612 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ZNF510Q9Y2H8 683 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TPRKBQ9Y3C4 175 aa7.37□□□□□ -1.23
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CPS1-201ENST00000233072 ADGRB2O60241 1585 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CCDC189A1A4V9 331 aa7.37□□□□□ -1.23
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CPS1-201ENST00000233072 CENPXA8MT69 81 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 E9PBE3 544 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 DDHD2O94830 711 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 VTNP04004 478 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CKMP06732 381 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CLTBP09497 229 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 FAM58BPP0C7Q3 252 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 PPATQ06203 517 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CRYMQ14894 314 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 NEK5Q6P3R8 708 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 FOXR2Q6PJQ5 311 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CASP12Q6UXS9 341 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 GLMNQ92990 594 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 FAM118BQ9BPY3 351 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 POLLQ9UGP5 575 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 A0A087X0T9 212 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MSCO60682 206 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ANXA6P08133 673 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 FAM228BP0C875 321 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 KCNJ1P48048 391 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 PSEN2P49810 448 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CSHL1Q14406 222 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 PARP6Q2NL67 630 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 LRRC38Q5VT99 294 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 LAYNQ6UX15 382 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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CPS1-201ENST00000233072 FLCNQ8NFG4 579 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MOSPD2Q8NHP6 518 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ATL1Q8WXF7 558 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CBWD1Q9BRT8 395 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MRIQ9BWK5 157 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CAAP1Q9H8G2 361 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 POPDC2Q9HBU9 364 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TCF7L2Q9NQB0 619 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MEGF6O75095 1541 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 WWP2O00308 870 aa7.37□□□□□ -1.23
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CPS1-201ENST00000233072 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
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CPS1-201ENST00000233072 C16orf62Q7Z3J2 963 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 DHFR2Q86XF0 187 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CCDC103Q8IW40 242 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
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CPS1-201ENST00000233072 AGXT2Q9BYV1 514 aa7.37□□□□□ -1.23
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CPS1-201ENST00000233072 TSPAN16Q9UKR8 245 aa7.37□□□□□ -1.23
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CPS1-201ENST00000233072 COL1A2P08123 1366 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 E2F8A0AVK6 867 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ABHD2P08910 425 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 GYS1P13807 737 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SLC16A1P53985 500 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CDK16Q00536 496 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 INAQ16352 499 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 INSCQ1MX18 579 aa7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 FBXW10Q5XX13 1052 aa7.37□□□□□ -1.23
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