RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ttc30a1Q99J38 664 aa21.26■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AticQ9CWJ9 592 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 VasnQ9CZT5 673 aa21.26■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gstt4Q9D4P7 240 aa21.26■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ttc33Q9D6K7 262 aa21.26■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Itgb3O54890 787 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ly6dP35459 127 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PrkczQ02956 592 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ano7Q14AT5 859 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lrrc74bQ14BP6 391 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trim71Q1PSW8 855 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Faf2Q3TDN2 445 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nlrc4Q3UP24 1024 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mysm1Q69Z66 819 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pcmtd2Q8BHD8 359 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SowahaQ8BLS7 548 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cgrrf1Q8BMJ7 332 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Svs3bQ8BZH8 265 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Agbl2Q8CDK2 862 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kctd15Q8K0E1 283 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Adgrg3Q8R0T6 542 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pomgnt1Q91X88 660 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Micu3Q9CTY5 523 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Klhl35Q9CZ49 574 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Utp11Q9CZJ1 253 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mms19Q9D071 1031 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atg7Q9D906 698 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tubb3Q9ERD7 450 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Asah2Q9JHE3 756 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TfebQ9R210 475 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Asb1Q9WV74 336 aa21.25■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smok3cA0A087WSF2 504 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr391-psA0A0U1RNJ4 312 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc6a21A0A1B0GSD2 748 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 UprtB1AVZ0 310 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm9857F7CXR1 130 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Abhd12bG3UZN6 359 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn2r1O70410 912 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ap1g1P22892 822 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sept4P28661 478 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Btg3P50615 252 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sesn2P58043 480 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prdx5P99029 210 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Proser1Q5PRE5 913 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Il17aQ62386 158 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Phlda1Q62392 405 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q810S2 196 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nat14Q8BVG8 206 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc39a3Q99K24 317 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mgrn1Q9D074 532 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Actrt2Q9D9L5 377 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Serpinb9bQ9DAV6 377 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spag6Q9JLI7 507 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cul3Q9JLV5 768 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sh2d3cQ9QZS8 854 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfc3h1B2RT41 1992 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr271-ps1A0A1L1SQH2 283 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zbed6D2EAC2 980 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ism2D3Z6A3 493 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn2r17E9PYF5 849 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm3415J3QMS8 315 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Asgr1P34927 284 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Usp10P52479 792 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pcsk1P63239 753 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PrkcqQ02111 707 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fbxw8Q8BIA4 598 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pak5Q8C015 719 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PigwQ8C398 503 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lin52Q8CD94 116 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Stau2Q8CJ67 570 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smyd2Q8R5A0 433 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Alas1Q8VC19 642 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1494Q8VGP8 315 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sult5a1Q91X36 291 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pcdhb4Q91XZ6 784 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rnf112Q96DY5 654 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm3404Q9D506 307 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krt16Q9Z2K1 469 aa21.24■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1700031M16RikA0A087WSH0 82 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mindy4b-psA0A1W2P7H6 457 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm15155B1B034 138 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 2010300C02RikE9Q3M9 1175 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kcng2F7A6P6 480 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mcpt1P11034 246 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PolgP54099 1218 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atp9bP98195 1146 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Grid2ipQ0QWG9 1203 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cntnap5bQ0V8T8 1292 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cyp2c29Q64458 490 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CyldQ80TQ2 952 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Arhgap15Q811M1 481 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc151Q8BSN3 593 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Taf5Q8C092 801 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Uba3Q8C878 462 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mkl1Q8K4J6 964 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 GcshQ91WK5 170 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Arhgef3Q91X46 524 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Glra3Q91XP5 464 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TfQ921I1 697 aa21.23■□□□□ 0.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tas1r2Q925I4 843 aa21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19 ms