RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PigaQ64323 485 aa10.2□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fbxo10Q7TQF2 950 aa10.2□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lacc1Q8BZT9 430 aa10.2□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ItchQ8C863 864 aa10.2□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Polr2bQ8CFI7 1174 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ago2Q8CJG0 860 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc51aQ8R000 340 aa10.2□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lactb2Q99KR3 288 aa10.2□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lrrc18Q9CQ07 262 aa10.2□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vta1Q9CR26 309 aa10.2□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zcchc12Q9CZA5 402 aa10.2□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cst12Q9DAN8 128 aa10.2□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mpp5Q9JLB2 675 aa10.2□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ap4s1Q9WVL1 144 aa10.2□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arih1Q9Z1K5 555 aa10.2□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pabpc4lG5E8X2 370 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Capn5O08688 640 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Enpp1P06802 906 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ephx2P34914 554 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc1a2P43006 572 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Scg3P47867 471 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q5EBG8 199 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CttnQ60598 546 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Htr1aQ64264 421 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fcrl5Q68SN8 596 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ppm1lQ8BHN0 360 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sfr1Q8BP27 319 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Phactr3Q8BYK5 558 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ston2Q8BZ60 895 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Socs4Q91ZA6 436 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dpp3Q99KK7 738 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arhgef25Q9CWR0 618 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Noxred1Q9D3S5 366 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nrf1Q9WU00 503 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Racgap1Q9WVM1 628 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm43518A0A0G2JGB6 165 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mroh4G3X8W1 983 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 2610028H24RikG5E8K1 270 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TazI7HJS2 263 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pde9aO70628 534 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Psmd7P26516 321 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PkmP52480 531 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zscan2Q07230 614 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q32M26 199 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HexdcQ3U4H6 486 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kctd21Q3URF8 260 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pcsk7Q61139 770 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Serpinb3dQ6UKZ0 387 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q810S2 196 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plin5Q8BVZ1 463 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Aph1bQ8C7N7 257 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plbd1Q8VCI0 550 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc5a2Q923I7 670 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pkp2Q9CQ73 795 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ist1Q9CX00 362 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem59Q9QY73 323 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ap1m2Q9WVP1 423 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 2310061I04RikB8JJ69 315 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pknox1O70477 436 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CblP22682 913 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AdslP54822 484 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sycp3P70281 254 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 UtyP79457 1212 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sh3bp2Q06649 559 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pag1Q3U1F9 429 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ttc9Q3V038 219 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Traf3Q60803 567 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Wee2Q66JT0 555 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dennd2cQ6P9P8 914 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr834Q7TRG8 312 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PaoxQ8C0L6 504 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Serpinb10Q8K1K6 397 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ptbp2Q91Z31 531 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rnf112Q96DY5 654 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rsph14Q9D3W1 341 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Clvs1Q9D4C9 354 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Chst7Q9EP78 484 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kdelc1Q9JHP7 502 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arid3bQ9Z1N7 568 aa10.19□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lbhd1A0A087WPA0 259 aa10.18□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Iqcj-Schip1A0A088MLT8 559 aa10.18□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dpy19l4A2AJQ3 722 aa10.18□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spin2dB1B0R2 236 aa10.18□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Clca3bE9PUL3 1044 aa10.18□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trim5E9PV98 497 aa10.18□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Herc6F2Z461 1003 aa10.18□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm21738J3QP72 227 aa10.18□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc27a3O88561 667 aa10.18□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Schip1P0DPB4 484 aa10.18□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cetn1P41209 172 aa10.18□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 EsrrgP62509 458 aa10.18□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ncf1Q09014 390 aa10.18□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mcm9Q2KHI9 1134 aa10.18□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Armc7Q3UJZ3 198 aa10.18□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Capn13Q3UW68 665 aa10.18□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Otol1Q4ZJM7 482 aa10.18□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Foxd4Q60688 444 aa10.18□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mef2aQ60929 498 aa10.18□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Efr3bQ6ZQ18 817 aa10.18□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zcchc4Q8BKW4 512 aa10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.9 ms