RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640634.1

SCARB2-222, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5

Gene SCARB2, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-222	ENST00000640634	TCF4	P15884	667 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	GPD1	P21695	349 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	IRAK1	P51617	712 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	HDAC4	P56524	1084 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	RUNX3	Q13761	415 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	PLD4	Q96BZ4	506 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	NUP85	Q9BW27	656 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	ECT2	Q9H8V3	914 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	PARVA	Q9NVD7	372 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	TNFRSF10A	O00220	468 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	CYP1A2	P05177	515 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	SDC4	P31431	198 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	NUMB	P49757	651 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	DEUP1	Q05D60	604 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	DHCR24	Q15392	516 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	CCDC185	Q8N715	623 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	NAT16	Q8N8M0	369 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	EDA	Q92838	391 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	IRF7	Q92985	503 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	RNF34	Q969K3	372 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	NDUFA10	O95299	355 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	GJA4	P35212	333 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	PTPN9	P43378	593 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC6A11	P48066	632 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	CXCR3	P49682	368 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	RING1	Q06587	406 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	PDGFRL	Q15198	375 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	ARC	Q7LC44	396 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	ATP2A3	Q93084	1043 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	PEBP4	Q96S96	227 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	FOXQ1	Q9C009	403 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	GFRA2	O00451	464 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	ACSL4	O60488	711 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	PAGE1	O75459	146 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	LCA5L	O95447	670 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	MYBL1	P10243	752 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	PSMA2	P25787	234 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	CTH	P32929	405 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	NNT	Q13423	1086 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	ANO4	Q32M45	955 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	ARTN	Q5T4W7	220 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	H2AFV	Q71UI9	128 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	C14orf80	Q86SX3	495 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	DNASE1L2	Q92874	299 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SCARB2-222	ENST00000640634	TRIM11	Q96F44	468 aa		11.34	□□□□□ -0.59

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