RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636621.1

LINC00598-211, long intergenic non-protein coding RNA 598, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC00598, Length 3,241 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00598-211ENST00000636621 CDH22Q9UJ99 828 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ADAM28Q9UKQ2 775 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 A0A0A0MRY4 1105 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 H3BNX3 289 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 UQCRBP14927 111 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 DPEP1P16444 411 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 PGAM1P18669 254 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SDC4P31431 198 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ARRB2P32121 409 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 GLUD2P49448 558 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 HK2P52789 917 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SNX16P57768 344 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 CCDC153Q494R4 210 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 LIN52Q52LA3 116 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ARHGAP17Q68EM7 881 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 CLEC14AQ86T13 490 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 TTC30AQ86WT1 665 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ATP2A3Q93084 1043 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SPATA13Q96N96 652 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 DTLQ9NZJ0 730 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 DERAQ9Y315 318 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 TPP1O14773 563 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 DENRO43583 198 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 HBP1O60381 514 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ARIH2O95376 493 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 C22orf31O95567 290 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ASPHQ12797 758 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ORC1Q13415 861 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SLC5A9Q2M3M2 681 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 HSDL1Q3SXM5 330 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 EPGNQ6UW88 154 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 LRRC71Q8N4P6 559 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 CSPG4P5Q96PW8 444 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ETAA1Q9NY74 926 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 BTBD7Q9P203 1132 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 HEY1Q9Y5J3 304 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 LTBP3Q9NS15 1303 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 TMEM114B3SHH9 223 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 IRF6O14896 467 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 OPHN1O60890 802 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ITGA2BP08514 1039 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 KRT19P08727 400 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 DESP17661 470 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ADORA2AP29274 412 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 IRX4P78413 519 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 RBP5P82980 135 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 GBE1Q04446 702 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 TMEM132DQ14C87 1099 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 CNPY1Q3B7I2 92 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 USP41Q3LFD5 358 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 OR6B2Q6IFH4 312 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 KCNT2Q6UVM3 1135 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 STRADAQ7RTN6 431 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 FBXW8Q8N3Y1 598 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 UBA3Q8TBC4 463 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 HTR3CQ8WXA8 447 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 CDKL2Q92772 493 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 RTKNQ9BST9 563 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 KLHL4Q9C0H6 718 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 EBF3Q9H4W6 596 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 POMPQ9Y244 141 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 CYP2C8P10632 490 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 KITP10721 976 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 VAV1P15498 845 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ITGAXP20702 1163 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms