RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC3Q9BY71 257 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 CHD9Q3L8U1 2897 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 DCLK1O15075 740 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 COCHO43405 550 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 APOEP02649 317 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 NR2C2P49116 596 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 CARSP49589 748 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 DRG2P55039 364 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 PTK6Q13882 451 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB30Q15771 203 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 ALLCQ8N6M5 410 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 SIK2Q9H0K1 926 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 HEY1Q9Y5J3 304 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 H0YGN5 161 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 DAPK3O43293 454 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 ERLIN1O75477 346 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 OAS1P00973 400 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 RBP3P10745 1247 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 ERCC2P18074 760 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 HTR7P34969 479 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 GGCXP38435 758 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 GBE1Q04446 702 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 CUL1Q13616 776 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 ARTNQ5T4W7 220 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 MANEALQ5VSG8 457 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 TMC8Q8IU68 726 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM114A2Q9NRY5 505 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 MSRAQ9UJ68 235 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 NEU3Q9UQ49 428 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 HS3ST4Q9Y661 456 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 OBSL1O75147 1896 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 PPM1LQ5SGD2 360 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 ELMOD1Q8N336 334 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC22A17Q8WUG5 538 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 IFT81Q8WYA0 676 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 BTN2A3PQ96KV6 586 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM121Q9BTD3 319 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM31Q9BZY9 425 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 DPH5Q9H2P9 285 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 CERS4Q9HA82 394 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 DTLQ9NZJ0 730 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 CEP290O15078 2479 aa25.7■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 CHD7Q9P2D1 2997 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 C2orf78A6NCI8 922 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 HOXC13P31276 330 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 PIK3R6Q5UE93 754 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 GSTA5Q7RTV2 222 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 NACA2Q9H009 215 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF38Q9H0F5 515 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 MAN1C1Q9NR34 630 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT14P02533 472 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 HMBSP08397 361 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 EPHB2P29323 1055 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 MTA1Q13330 715 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 XRCC4Q13426 336 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP2R2DQ66LE6 453 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 NUGGCQ68CJ6 796 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 HS6ST3Q8IZP7 471 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 OLFM3Q96PB7 478 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 C10orf88Q9H8K7 445 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 NFU1Q9UMS0 254 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 SNX24Q9Y343 169 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 MFSD11O43934 449 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 SRGAP2BP0DMP2 458 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 EPCAMP16422 314 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 GABRR2P28476 465 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 ECHS1P30084 290 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 BMP8BP34820 402 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL21P46778 160 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 COG7P83436 770 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 MS4A13Q5J8X5 152 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 TMCO3Q6UWJ1 677 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 GAREM2Q75VX8 874 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 UNC45BQ8IWX7 931 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC89Q8N998 374 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 LMAN2LQ9H0V9 348 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 H7C0C1 242 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 SGK1O00141 431 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 CCL16O15467 120 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP3K6O95382 1288 aa25.68■■□□□ 1.7
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