RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 SMARCD2Q92925 531 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 SNF8Q96H20 258 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 SLITRK1Q96PX8 696 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 TP73O15350 636 aa22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 VDRP11473 427 aa22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 SRFP11831 508 aa22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 LMNB2Q03252 620 aa22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 ORC1Q13415 861 aa22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 CNGA2Q16280 664 aa22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 TANGO2Q6ICL3 276 aa22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 POTEHQ6S545 545 aa22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 ASB16Q96NS5 453 aa22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 B3GNT5Q9BYG0 378 aa22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 MFSD1Q9H3U5 465 aa22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 CLDN5O00501 218 aa22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM66O15016 1216 aa22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 ECI2O75521 394 aa22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 IFFO1Q0D2I5 559 aa22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 SNX1Q13596 522 aa22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 BBOF1Q8ND07 529 aa22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 ATG4AQ8WYN0 398 aa22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 ELSPBP1Q96BH3 223 aa22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 ASIC4Q96FT7 647 aa22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 PGM2Q96G03 612 aa22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 CYTH4Q9UIA0 394 aa22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 EFR3BQ9Y2G0 817 aa22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 F8VP50 259 aa22.33■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 TJP3O95049 919 aa22.33■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 SSR1P43307 286 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 CYP4F8P98187 520 aa22.33■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 KRT71Q3SY84 523 aa22.33■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 STXBP5Q5T5C0 1151 aa22.33■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa22.33■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 CRYBG2Q8N1P7 616 aa22.33■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC89Q8N998 374 aa22.33■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 TLCD1Q96CP7 247 aa22.33■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 TWNKQ96RR1 684 aa22.33■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.33■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 HEMGNQ9BXL5 484 aa22.33■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 IL21Q9HBE4 155 aa22.33■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 ASIC3Q9UHC3 531 aa22.33■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 STK25O00506 426 aa22.33■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 KRT3P12035 628 aa22.33■■□□□ 1.16
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SGMS1-210ENST00000619438 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
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SGMS1-210ENST00000619438 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 SPATA17Q96L03 361 aa22.33■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 TASP1Q9H6P5 420 aa22.33■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 DPYSL4O14531 572 aa22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 RIPK2O43353 540 aa22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 F11P03951 625 aa22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 KRT1P04264 644 aa22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 VIPR2P41587 438 aa22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 LLGL1Q15334 1064 aa22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 STILQ15468 1287 aa22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 XYLT1Q86Y38 959 aa22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 C12orf29Q8N999 325 aa22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 CCHCR1Q8TD31 782 aa22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 C8orf48Q96LL4 319 aa22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 CEP295NLQ96MC4 621 aa22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 SEMA4AQ9H3S1 761 aa22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 WNT16Q9UBV4 365 aa22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 HMGXB4Q9UGU5 601 aa22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 TCF4P15884 667 aa22.31■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 ATP1A2P50993 1020 aa22.31■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 SLC29A2Q14542 456 aa22.31■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 MFSD7Q6UXD7 560 aa22.31■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 SIX5Q8N196 739 aa22.31■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 E2F7Q96AV8 911 aa22.31■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 MYRFLQ96LU7 910 aa22.31■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 CPXM1Q96SM3 734 aa22.31■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.31■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.31■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa22.31■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 CA14Q9ULX7 337 aa22.31■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 LIASO43766 372 aa22.3■■□□□ 1.16
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